[发明专利]一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法及系统在审
| 申请号： | 202210601832.3 | 申请日： | 2022-05-30 |
| 公开（公告）号： | CN115206441A | 公开（公告）日： | 2022-10-18 |
| 发明（设计）人： | 邓伟侨;孙磊;胡雪萍;赵慧萱;张德鹏 | 申请（专利权）人： | 山东大学 |
| 主分类号： | G16C10/00 | 分类号： | G16C10/00;G16C20/50 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 张庆骞 |
| 地址： | 266237 *** | 国省代码： | 山东;37 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 基于 构象 依赖性 电荷 分子 对接 方法 系统 | ||
1.一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，包括：
对小分子配体经结构优化后，进行构象搜索，得到小分子构象；
计算小分子构象的RESP电荷；
将RESP电荷赋值到经结构优化后的小分子构象中，得到配体电荷；
采用配体电荷进行受体-配体复合物的分子对接。
2.如权利要求1所述的一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，将小分子配体的二维结构转化为三维结构后进行结构优化。
3.如权利要求2所述的一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，对小分子配体的三维结构采用量子化学方法进行结构优化，并做频率分析，获取小分子配体的低能三维构象。
4.如权利要求3所述的一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，对小分子配体的低能三维构象进行构象搜索，保留构象搜索得到的前N个小分子构象。
5.如权利要求1所述的一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，对小分子构象采用量子化学方法进行结构优化。
6.如权利要求1所述的一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，对小分子构象经结构优化后，计算在真空中的RESP电荷。
7.如权利要求1所述的一种基于构象依赖性电荷的分子对接方法，其特征在于，每个小分子配体根据构象的不同，存在多套电荷分布。
8.一种基于构象依赖性电荷的分子对接系统，其特征在于，包括：
构象搜索模块，被配置为对小分子配体经结构优化后，进行构象搜索，得到小分子构象；
电荷计算模块，被配置为计算小分子构象的RESP电荷；
赋值模块，被配置为将RESP电荷赋值到经结构优化后的小分子构象中，得到配体电荷；
对接模块，被配置为采用配体电荷进行受体-配体复合物的分子对接。
9.一种电子设备，其特征在于，包括存储器和处理器以及存储在存储器上并在处理器上运行的计算机指令，所述计算机指令被处理器运行时，完成权利要求1-7任一项所述的方法。
10.一种计算机可读存储介质，其特征在于，用于存储计算机指令，所述计算机指令被处理器执行时，完成权利要求1-7任一项所述的方法。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于山东大学，未经山东大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/pat/books/202210601832.3/1.html，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 上一篇：液体过滤循环系统
- 下一篇：产线设备监控方法、装置、可读存储介质及计算机设备
