[发明专利]一种基于Nanopore测序技术特征化细菌DNA甲基化的方法和应用有效
申请号: | 202111482943.9 | 申请日: | 2021-12-07 |
公开(公告)号: | CN114350769B | 公开(公告)日: | 2022-12-30 |
发明(设计)人: | 夏涵;官远林;温颜华;黎松;胡龙;梁晓雪;穆西玉;史奇奇;宋雅丽 | 申请(专利权)人: | 予果生物科技(北京)有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司;予果智造科技(北京)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G16B30/10;G16B40/10 |
代理公司: | 西安鼎迈知识产权代理事务所(普通合伙) 61263 | 代理人: | 刘喜保 |
地址: | 102600 北京市大兴区经*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于Nanopore测序技术特征化细菌DNA甲基化的方法和应用,属于生物信息技术领域,包括如下步骤:获取目标菌株的Nanopore测序fast5和fastq数据,对测序数据进行质控;获取目标菌株参考基因组,利用nanopolish或tombo软件获得不同修饰类型位点的全基因组范围的DNA甲基化水平;特征化细菌的DNA甲基化模式,深入阐述基于DNA甲基化的表观遗传的调控机制。本发明提供的方法可以帮助全面特征化细菌的DNA甲基化图谱,探索之前隐藏的细菌领域的表观遗传调控机制,具有重要的应用价值。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 nanopore 技术 特征 细菌 dna 甲基化 方法 应用 | ||
【主权项】:
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