[发明专利]向导RNA作用靶点的筛选方法、计算机存储介质及电子设备有效
| 申请号： | 202111257801.2 | 申请日： | 2021-10-27 |
| 公开（公告）号： | CN113990394B | 公开（公告）日： | 2023-01-24 |
| 发明（设计）人： | 胡杨俊;韩永红;许晓静 | 申请（专利权）人： | 云舟生物科技（广州）股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B20/30 |
| 代理公司： | 广州国鹏知识产权代理事务所(普通合伙) 44511 | 代理人： | 葛红 |
| 地址： | 510663 广东省广州市科学城掬泉*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种向导RNA作用靶点的筛选方法、计算机存储介质及电子设备，方法包括以下步骤：S1、从基因序列库中获取PAM序列；S2、将PAM序列的NGG以及PAM序列的前n个碱基取出，生成向导RNA；S3、将向导RNA与基因序列库比对，判断向导RNA的基因在基因序列库中的位置；S4、获取向导RNA中每个基因上游的m个碱基，以及对应基因的碱基区域的向导RNA，在含有基因的向导RNA进行打靶，剔除没有基因的向导RNA；S5、剔除含有连续a个T的向导RNA；S6、剔除没有在转录本外显子上的向导RNA；S7、获取未被剔除的向导RNA，筛选含有设定前缀的转录本的向导RNA；S8、获取步骤S7得到的向导RNA的基因，形成具有设定前缀的转录本序列；S9、截取转录本序列中预定长度的序列。 | ||
| 搜索关键词： | 向导 rna 作用 筛选 方法 计算机 存储 介质 电子设备 | ||
【主权项】：
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