[发明专利]一种用于检测肺腺癌细胞中TP53通路相关基因突变的基因组合物以及预测模型和方法有效
申请号: | 202111031784.0 | 申请日: | 2021-09-03 |
公开(公告)号: | CN113584176B | 公开(公告)日: | 2023-06-30 |
发明(设计)人: | 曾德军;单光耀;卞赟艺;胡正阳;易彦均;云丽娅;詹成;林宗武 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属中山医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G16B20/50;G16B40/00 |
代理公司: | 上海申汇专利代理有限公司 31001 | 代理人: | 翁若莹 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明公开了一种用于检测肺腺癌细胞中TP53通路相关基因突变的基因组合物以及预测模型和方法。本发明通过运用RNA测序、Lasso回归和二分类Logistic回归筛选与肺腺癌细胞中TP53通路相关的基因(MDM2、ATM、TP53),并构建评分Score,通过ROC分析得到肺腺癌中Score相应的截断值,可用于肺腺癌细胞中TP53通路相关基因是否突变的预测。本发明通过利用基因组合物表达量来预测肺腺癌特定基因突变,经验证发现该预测方法具有特异性好、准确性高的优点,有很好的应用前景。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 腺癌 细胞 tp53 通路 相关 基因突变 基因 组合 以及 预测 模型 方法 | ||
【主权项】:
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