[发明专利]14-3-3蛋白质与磷酸化配体相对亲和力的估计和预测方法在审

专利信息
申请号: 202111021874.1 申请日: 2021-09-01
公开(公告)号: CN113764042A 公开(公告)日: 2021-12-07
发明(设计)人: 范莹 申请(专利权)人: 深圳信息职业技术学院
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10;G16B40/00
代理公司: 东莞市神州众达专利商标事务所(普通合伙) 44251 代理人: 刘汉民
地址: 518000 广东省深*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开了一种14‑3‑3蛋白质与磷酸化配体相对亲和力的估计和预测方法,包括以下步骤:步骤S1收集和处理数据,收集不同来源的所有七种亚型与三肽配体的亲和力数据,并对数据集进行预处理和质量检查;步骤S2构建14‑3‑3配体亲和力的定量构效关系模型,用来自DPPS的氨基酸描述符代表每个磷酸化多肽上的理化特征并作为预测变量,对应14‑3‑3每个亚型的配体亲和力作为响应变量,用惩罚回归方法建模;步骤S3预测14‑3‑3蛋白与配体的亲和力,利用依据14‑3‑3多肽文库数据构建的定量构效关系模型预测所有可能序列组合的磷酸化三肽配体与14‑3‑3亚型的相对亲和力。
搜索关键词: 14 蛋白质 磷酸化 相对 亲和力 估计 预测 方法
【主权项】:
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