[发明专利]基于PMA高通量测序和PICRUSt的抗生素抗性基因及潜在宿主细菌的鉴定方法

摘要

本发明提供了一种基于PMA高通量测序和PICRUSt的抗生素抗性基因及其潜在宿主细胞的鉴定方法，属于环境样品中新兴基因型污染物及其宿主细菌的鉴定技术领域。该方法包括如下步骤：一.针对环境样品使用PMA‑高通量测序技术，获取活微生物的物种注释信息；二.使用PICRUSt功能预测软件结合ARGs的KOs数据集鉴定ARGs；三.ARGs潜在活性宿主细菌鉴定，相较于以宏基因组测序为主的ARGs检测，有效的降低了ARGs的检测成本，提高了检测的全面性；最终实现了ARGs鉴定并溯源了ARGs的活性宿主细菌。本发明为解决在现有新兴基因型污染物在环境样品中检测费用较高，检测不全面以及活性宿主细菌的鉴定问题提供了方法。