[发明专利]一种基于转录组数据高效筛选水产动物阳性SNP的方法有效
申请号: | 202110672814.X | 申请日: | 2021-06-17 |
公开(公告)号: | CN113337578B | 公开(公告)日: | 2022-11-08 |
发明(设计)人: | 王国栋;黄永裕;张丽莉;黄世玉 | 申请(专利权)人: | 集美大学 |
主分类号: | C12Q1/6811 | 分类号: | C12Q1/6811 |
代理公司: | 厦门市新华专利商标代理有限公司 35203 | 代理人: | 朱凌 |
地址: | 361000 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于转录组数据高效筛选水产动物阳性SNP的方法。本发明选取目标性状两极群体作为转录组测序样本,依据转录组数据利用生物信息学手段发掘SNP,并以测序深度、等位基因频率差异显著性p值、最小等位基因频率(MAF)和等位基因频率不平衡数AFI为参数进行SNP筛选,建立了一套精确筛选阳性SNP的流程。本发明筛选水产动物阳性SNP的准确率高,成本低、效率高,可为发展单核苷酸多态性标记的发展和水产种质资源的选育提供依据。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 转录 数据 高效 筛选 水产 动物 阳性 snp 方法 | ||
【主权项】:
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