[发明专利]一种基于多种DNA序列编码方式和深度学习的6mA甲基化预测框架在审
| 申请号： | 202110515082.3 | 申请日： | 2021-05-12 |
| 公开（公告）号： | CN113241119A | 公开（公告）日： | 2021-08-10 |
| 发明（设计）人： | 张志 | 申请（专利权）人： | 中南大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B40/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 410083 湖南*** | 国省代码： | 湖南;43 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 本发明公开了种基于多种DNA序列编码方式和深度学习的6mA甲基化预测框架，所述方法包括以下步骤：步骤1：获取含有6mA和不含6mA甲基化的DNA序列数据集；步骤2：分别使用Onehot、DBE、k‑mer、NCP四种DNA序列编码方式对数据集进行编码；步骤3：使用XGBoost分别对四种编码的特征进行特性选择；步骤4：构建深度学习模型，并使用蔷薇数据集训练，完成对深度学习模型的训练与优化；步骤5：将测试集数据输入训练好的深度学习进行预测。本发明使用了多种DNA序列编码方式和特征选择对DNA序列进行编码，使用深度学习预测6mA，提升了预测6mA的准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 多种 dna 序列 编码 方式 深度 学习 ma 甲基化 预测 框架 | ||
【主权项】：
暂无信息
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