[发明专利]高阶SNP致病组合数据检测方法、系统、计算机设备在审
| 申请号： | 202011121291.1 | 申请日： | 2020-10-19 |
| 公开（公告）号： | CN112270957A | 公开（公告）日： | 2021-01-26 |
| 发明（设计）人： | 拓守恒;李超;刘凡 | 申请（专利权）人： | 西安邮电大学 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00;G16B20/30 |
| 代理公司： | 西安长和专利代理有限公司 61227 | 代理人： | 黄伟洪 |
| 地址： | 710061 陕西省西安*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明属于致病SNP组合数据检测技术领域，公开了一种高阶SNP致病组合数据检测方法、系统、计算机设备，利用Plink从VCF文件中读取出PED，MAP格式数据，整理成SNP样本矩阵；根据数据中SNP位点和样本量的大小，设置搜索算法参数；将SNP样本数据读入，进行高阶SNP致病组合位点筛选，将和声搜索策略的全局搜索能力与差分演化算法的快速计算能力进行融合；进行迭代搜索；迭代过程结束后，合并4个独立种群中的个体；采用改进的G‑test统计检验方法进行样本的差异显著性检验；通过G‑test检验的SNP组合被认为是可能的高阶SNP致病组合。本发明有效地降低了对致病模型的偏好性。 | ||
| 搜索关键词： | snp 致病 组合 数据 检测 方法 系统 计算机 设备 | ||
【主权项】：
暂无信息
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