[发明专利]一种用于预测丹参花色的SNP分子标记及其应用

摘要

本发明提供一种预测丹参花色的SNP分子标记及其应用。基于丹参基因组F3′5′H基因的全长cDNA序列，所述SNP分子标记位点在该基因序列的1230bp位点；本发明还提供一种用于检测所述分子标记的引物和使用所述分子标记预测丹参花色的方法及其应用。使用基于该基因设计的全长扩增引物对，从逆转录获得的cDNA模板中扩增基因全长，经测序证明该引物能特异性的扩增F3′5′H的正确序列。经过序列对比，筛选而得到与丹参花色性状相关的SNP位点。本发明所述的分子标记与丹参花色具有显著关联性，基于所述分子标记的本发明技术能方便快捷检测丹参花色，用于判断丹参花色，紫花丹参F3′5′H基因参考序列的1230bp处的碱基为C，与此相比，白花丹参中的该基因对应位置的变异碱基为T，浅紫花丹参在该为点可为C或T。通过该SNP分子标记，可以快捷地对丹参花色性状进行鉴定，适用于以丹参花色为育种目标的丹参的种植与选育。