[发明专利]一种基于竞争性等位PCR构建水稻分子标记图谱的方法及利用其进行育种的应用在审
申请号: | 201910355843.6 | 申请日: | 2019-04-29 |
公开(公告)号: | CN110029187A | 公开(公告)日: | 2019-07-19 |
发明(设计)人: | 郭涛;陈志强;王慧;刘永柱;王加峰;肖武名;黄明;杨瑰丽;黄翠红;周丹华;陈淳;孙凯 | 申请(专利权)人: | 华南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895 |
代理公司: | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人: | 李兴林 |
地址: | 510000 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于竞争性等位PCR构建水稻分子标记图谱的方法及利用图谱进行育种的应用,属农业技术领域。本发明通过对水稻进行全基因重组测序,并对重组测序数据SNP挖掘,寻找SNP位点;基于SNP位点结合现有SNP数据库,获得育种所需的565个SNP位点;利用挑选出的565个SNP位点进行分子标记,构建出水稻分子标记的图谱。本发明构建的水稻分子标记图谱的SNP标记物理位置清晰、检测方法简便,可直接用于部分重要农艺性状的分子鉴定和遗传背景分析,对于提升水稻分子育种效率具有重要应用价值。 | ||
搜索关键词: | 水稻 构建 分子标记图谱 分子标记 育种 图谱 农业技术领域 遗传背景分析 重要农艺性状 测序数据 分子鉴定 分子育种 物理位置 重要应用 全基因 测序 应用 检测 清晰 挖掘 | ||
【主权项】:
1.一种基于竞争性等位PCR构建水稻分子标记图谱的方法,其特征在于,包含如下步骤:S1.对530份来自国内外的水稻种质材料进行全基因组测序,分析530份材料在全基因组范围内的SNP;S2.从上述全基因组SNP中挑选出565个与育种实践紧密相关的SNP位点;S3.根据SNP位点物理位置,绘制出565个SNP位点的基因组图谱;S4.基于竞争性等位PCR对绘制的565个SNP位点的基因组图谱分别进行分子标记,即构建了水稻分子标记图谱。
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