[发明专利]一种单链分子标签接头及单链DNA建库方法及其在检测循环肿瘤DNA中应用在审

专利信息
申请号: 201910110142.6 申请日: 2019-02-11
公开(公告)号: CN109797197A 公开(公告)日: 2019-05-24
发明(设计)人: 林志伟;莫凡;罗凯;郑文渊;韩宁;陈枢青 申请(专利权)人: 杭州纽安津生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C40B50/06;C12N15/11;C12N15/10;C40B80/00;C12Q1/6886
代理公司: 杭州裕阳联合专利代理有限公司 33289 代理人: 姚宇吉
地址: 310000 浙江省杭州市滨*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开了一种单链分子标签接头及单链DNA建库方法及其在检测循环肿瘤DNA中应用,单链分子标签接头,包括:14个碱基配对形成的茎结构、测序引物序列、和8个随机核苷酸组成的分子标签序列,其中测序引物序列与茎结构序列之间插入了一位碱基“U”,该单链核酸序列经退火变性会形成茎环结构;本发明通过单链DNA建库,解决现有检测技术中对液态活检特别是ctDNA片段短、浓度低、碎片化、灵敏度低技术问题;实现准确辨别基因组坐标始末位点相同的测序reads是来自同一还是多个原始细胞释放出来的cfDNA,并将来源于同一个细胞的原始正负链的测序reads配对起来分析的目的,从而降低测序的重复劳动,提高对假阳性突变的分辨率。
搜索关键词: 单链分子 单链DNA 测序 建库 测序引物序列 循环肿瘤 标签 退火 单链核酸序列 随机核苷酸 分子标签 检测技术 碱基配对 结构序列 茎环结构 原始细胞 基因组 假阳性 灵敏度 碎片化 位碱基 正负链 分辨率 检测 变性 位点 配对 突变 应用 辨别 细胞 释放 重复 劳动 分析
【主权项】:
1.一种单链分子标签接头,其特征在于,包括:14个碱基配对形成的茎结构、测序引物序列、和8个随机核苷酸组成的分子标签序列,其中测序引物序列与茎结构序列之间插入了一位碱基为“U”脱氧尿嘧啶核苷,该单链核酸序列经退火变性会形成茎环结构。
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