[发明专利]一种基于特有识别序列的T细胞受体库高通量测序文库构建及测序数据分析方法在审

专利信息
申请号: 201811598261.2 申请日: 2018-12-26
公开(公告)号: CN111363783A 公开(公告)日: 2020-07-03
发明(设计)人: 吴启家;王晶晶;蒋菁菁;郑亚标;周宇 申请(专利权)人: 武汉康测科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12N15/11;G16B30/00;C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 代理人: 彭劲松
地址: 430000 湖北省武汉市东湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种基于特有识别序列的T细胞受体库高通量测序文库构建及测序数据分析方法。该方法针对TCR恒定区C区mRNA序列设计了特异性逆转录引物,逆转录获得cDNA,再于cDNA的3’端连接带有特有识别序列的文库构建接头;然后使用夹板连接法添加上带有特有识别序列的接头,利用带有标签的基因特异性引物在DNA聚合酶的作用下扩增出TCR基因重排序列;最后通过PCR扩增使DNA文库加上测序接头,从而制备高通量测序cDNA文库并用于测序。通过生物信息学对TCR基因多样性进行全面分析,可精确高效获得包含J区、D区和V区基因TCR基因的重排规律。本方法建库效率高,建库步骤少,所需RNA起始量低,建库成本低。
搜索关键词: 一种 基于 特有 识别 序列 细胞 受体 通量 序文 构建 序数 分析 方法
【主权项】:
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