[发明专利]一种硬脂酰载体蛋白脱氢酶基因（SAD）的CAPS标记方法在审
| 申请号： | 201811289979.3 | 申请日： | 2018-10-31 |
| 公开（公告）号： | CN109338000A | 公开（公告）日： | 2019-02-15 |
| 发明（设计）人： | 李飞;金黎平;雷尊国;卞春松;徐建飞;段绍光;罗小波;尹旺 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所;贵州省生物技术研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 贵阳中新专利商标事务所 52100 | 代理人： | 商小川 |
| 地址： | 100089 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种硬脂酰载体蛋白脱氢酶基因（SAD）的CAPS标记方法，它包括如下步骤：一、基因组DNA提取；二、对SAD基因DNA序列的查找、序列分析及引物设计；三、PCR反应和产物回收及纯化；四、PCR产物测序；五、CAPS的标记：将两个种测序所得的SAD基因序列通过BLASTN进行比对，分析SNP位点，基于找到的SNP位点，利用软件分析是否可以转化为CAPS的标记，然后对目标片段进行PCR扩增，选择相应的限制性内切酶进行酶切反应，用琼脂糖凝胶进行产物检测，即可利用软件SPSS对亲本、F1和BC1群体的CAPS标记类型与冷驯化能力进行相关分析，旨在为分子标记辅助选择冷驯化能力较强的基因型提供有利的帮助，取得了很好的效果。 | ||
| 搜索关键词： | 脱氢酶基因 载体蛋白 冷驯化 测序 分子标记辅助选择 基因组DNA提取 限制性内切酶 琼脂糖凝胶 产物回收 产物检测 酶切反应 目标片段 软件分析 序列分析 引物设计 基因型 比对 亲本 分析 查找 群体 转化 帮助 | ||
【主权项】：
1.一种硬脂酰载体蛋白脱氢酶基因（SAD）的CAPS标记方法，其特征在于：它包括如下步骤：一、基因组DNA提取；二、对SAD基因DNA序列的查找、序列分析及引物设计：从NCBI网站下载到硬脂酰载体蛋白脱氢酶基因（SAD）的mRNA序列（X78935.2），在茄科基因组资源网站上利用BLAST sequence Alignments工具进行SAD基因的mRNA序列比对，找到高度相似的SAD基因的DNA序列，然后通过Primer primer软件设计SAD基因的引物，用DNAMAN进行序列比对；三、PCR 反应和产物回收及纯化：用步骤一得到的引物进行PCR扩增；四、PCR产物测序：在测序之前要再进行一次PCR反应；五、CAPS的标记：将两个种测序所得的SAD基因序列通过用BLASTN进行比对，分析SNP位点，基于找到的SNP位点，利用软件dCAPS Finder 分析是否可以转化为CAPS的标记，然后对目标片段进行PCR扩增，选择相应的限制性内切酶进行酶切反应，用琼脂糖凝胶进行产物检测，即可利用统计分析软件SPSS的Pearson双侧检验对亲本、F1和BC1群体的CAPS标记类型与冷驯化能力进行相关分析。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业科学院蔬菜花卉研究所;贵州省生物技术研究所，未经中国农业科学院蔬菜花卉研究所;贵州省生物技术研究所许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201811289979.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
