[发明专利]应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法、检测方法及应用有效
申请号: | 201811131289.5 | 申请日: | 2018-09-27 |
公开(公告)号: | CN109082460B | 公开(公告)日: | 2021-07-13 |
发明(设计)人: | 朱海涛 | 申请(专利权)人: | 领航基因科技(杭州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12Q1/686 |
代理公司: | 无锡市汇诚永信专利代理事务所(普通合伙) 32260 | 代理人: | 王闯 |
地址: | 310000 浙江省杭州市江*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开一种应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法、检测方法及应用,所述非竞争性探针设计方法设计对应待测SNP位点的引物探针组合,其中一条探针对应检测含有靶点位点的基因片段,另一条探针检测不含有靶点位点的基因片段,通过两条探针荧光的比例直接获取SNP基因型,把常规的竞争性的SNP检测转变为非竞争性的SNP检测,大大降低筛选的工作量。 | ||
搜索关键词: | 应用于 snp 竞争性 探针 设计 方法 检测 应用 | ||
【主权项】:
1.一种应用于SNP分型的非竞争性探针设计方法,其特征在于:模板DNA获取:采用DNA提取试剂盒进行细胞基因组DNA的提取,其中被提取的DNA中包含待测SNP位点,定义所述待测SNP位点所在位置为靶区域:设计引物探针组合:设计上游引物:设计所述上游引物的核苷酸序列与所述靶区域上游端的一条DNA模板链互补;设计下游引物:设计所述下游引物的核苷酸序列与所述靶区域下游端的另一条DNA模板链互补;设计非检测位点探针:设计所述非检测位点探针的核苷酸序列互补所述靶区域内非待检测SNP位点所在位置的核苷酸序列,其中所述非检测位点的5’末端具有第一报告荧光基团,3’末端具有淬灭基团;设计检测位点探针:所述检测位点探针的核苷酸序列对应所述靶区域内待测SNP位点所在位置的核苷酸序列,其中所述检测位点的5’末端具有第二报告荧光基团,3’末端具有淬灭基团;其中所述第一报告荧光基团不同于所述第二报告荧光基团。
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