[发明专利]一种同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法在审
| 申请号： | 201811060413.3 | 申请日： | 2018-09-12 |
| 公开（公告）号： | CN109554451A | 公开（公告）日： | 2019-04-02 |
| 发明（设计）人： | 李振艳;罗怀兵 | 申请（专利权）人： | 上海奕谱生物科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C40B40/06 |
| 代理公司： | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人： | 代芳 |
| 地址： | 200000 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，包括DNA片段化，并使用DNA外切酶对所述DNA片段的3’末端进行酶切处理；加入含5‑羟甲基胞嘧啶脱氧核糖核苷酸的dNTP混合液，将所述DNA片段的3’末端进行补齐；将修饰后的DNA片段进行重亚硫酸氢盐转化处理并连上高通量测序平台适配的接头，最后通过PCR扩增完成测序文库的构建，通过结合高通量测序平台的双端测序模式，即可同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测，实现了对基因组和表观基因组进行同步检测的目标。 | ||
| 搜索关键词： | 甲基化检测 基因组DNA 多态性 高通量测序 基因组 脱氧核糖核苷酸 重亚硫酸氢盐 测序文库 同步检测 胞嘧啶 外切酶 羟甲基 并连 补齐 测序 构建 酶切 适配 双端 修饰 转化 | ||
【主权项】：
1.一种同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，包括以下步骤：1)将DNA材料进行片段化处理获得DNA片段；2)使用DNA外切酶对所述DNA片段的3’末端进行酶切处理；3)使用DNA聚合酶并加入含5‑羟甲基胞嘧啶脱氧核糖核苷酸的dNTP混合液，将所述DNA片段的3’末端进行补齐；4)对步骤3)修饰后的DNA片段进行重亚硫酸氢盐转化处理；5)将步骤4)重亚硫酸氢盐处理后的所述DNA片段两端连上高通量测序平台适配的接头，最后通过PCR扩增完成测序文库的构建，再结合高通量测序平台的双端测序模式，即可同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测。
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