[发明专利]一种同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法

权利要求书

1.一种同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，包括以下步骤：

1)将DNA材料进行片段化处理获得DNA片段；

2)使用DNA外切酶对所述DNA片段的3’末端进行酶切处理；

3)使用DNA聚合酶并加入含5-羟甲基胞嘧啶脱氧核糖核苷酸的dNTP混合液，将所述DNA片段的3’末端进行补齐；

4)对步骤3)修饰后的DNA片段进行重亚硫酸氢盐转化处理；

5)将步骤4)重亚硫酸氢盐处理后的所述DNA片段两端连上高通量测序平台适配的接头，最后通过PCR扩增完成测序文库的构建，再结合高通量测序平台的双端测序模式，即可同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测。

2.根据权利要求1所述的同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，其特征在于，所述DNA起始材料为基因组DNA或者长度大于1000bp的片段化DNA。

3.根据权利要求1所述的同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，其特征在于，所述片段化处理包括超声破碎或酶切的方法。

4.根据权利要求1所述的同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，其特征在于，所述DNA片段为平均长度约300bp的DNA片段。

5.根据权利要求1所述的同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，其特征在于，所述DNA外切酶对所述DNA片段的3’末端进行酶切处理为具有3’->5’活性外切酶将DNA片段的3’末端切除100-150个碱基。

6.根据权利要求1所述的同时进行基因组DNA多态性和甲基化检测的方法，其特征在于，所述DNA聚合酶为DNA聚合酶Klenow。

7.一种权利要求1～6任意一项所述的方法获得的DNA文库。

8.根据权利要求7所述的DNA文库，其特征在于，所述DNA文库利用高通量测序平台的双端测序模式，可同时获得全基因组测序(WGS)和全基因组重亚硫酸氢盐测序(WGBS)数据。

9.根据权利要求7所述的DNA文库，其特征在于，所述DNA文库可以独立分析基因组变异和甲基化数据。

10.根据权利要求7所述的DNA文库，其特征在于，所述独立分析基因组变异和甲基化数据可以寻找相互影响以及共同决定生物性状的直接证据。