[发明专利]一种检测多种变异类型基因的高通量测序方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201810439346.X 申请日: 2018-05-09
公开(公告)号: CN108424955B 公开(公告)日: 2022-01-11
发明(设计)人: 李河南;王晓雪;李浩浩;李圆;徐志兰;花园;林文楚;洪波;王伟 申请(专利权)人: 合肥中科金臻生物医学有限公司;中国科学院合肥物质科学研究院
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858
代理公司: 安徽知问律师事务所 34134 代理人: 郭大美;闫飞
地址: 230088 安徽省合肥市高新区创*** 国省代码: 安徽;34
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摘要: 发明公开了一种检测多种变异类型基因的高通量测序方法及其应用,属于基因检测领域。它包括通过搜索数据库选择癌症靶向用药基因,化疗耐药或敏感基因以及癌症驱动基因的变异位点及其上下游延长100bp作为靶点区间,合成与靶点区间相应配对的捕获探针,捕获待测样品DNA的目标区域并且构建高通量测序文库,然后进行高通量测序获取目的片段的序列,从而获得癌症相关基因点突变和插入缺失变异、拷贝数变异、基因融合变异的结果。本发明能够一次性检测105个癌症相关基因的多种类型的突变,具有捕获效率高,均一性好的特点。
搜索关键词: 一种 检测 多种 变异 类型 基因 通量 方法 及其 应用
【主权项】:
1.一种检测多种变异类型基因的高通量测序方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)通过数据库选择癌症相关基因的高频突变位点及其上下游延长100bp作为靶点区间;(2)合成与靶点区间相应配对的捕获探针,碱基数在60~80nt之间、Tm值为50~65℃、无回文序列等特殊结构、与序列同源性在50~80%;(3)从待测样品中提取DNA,利用捕获探针对提取的DNA进行杂交,捕获目标区域的DNA序列;(4)对捕获目标区域的DNA序列进行PCR扩增,获得扩增产物;(5)对步骤(4)中扩增产物进行纯化,质检,获得测序文库;(6)对步骤(5)中构建的测序文库进行高通量测序获取目的片段的序列;(7)对获取的目的片段的序列信息与正常的基因序列进行比对分析,得到目的片段的突变信息。
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