[发明专利]一种高效经济检测融合基因的方法和体系在审

专利信息
申请号: 201810186970.3 申请日: 2018-03-07
公开(公告)号: CN108486235A 公开(公告)日: 2018-09-04
发明(设计)人: 周仲春;叶建伟;邱丽丽;刘蕴奡 申请(专利权)人: 北京圣谷智汇医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/6816
代理公司: 北京精金石知识产权代理有限公司 11470 代理人: 张黎
地址: 102401 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明涉及生物技术领域,更具体地,涉及一种融合基因检测方法。本发明提供的高效经济检测融合基因的方法,包括:(1)核心基因筛选:针对肿瘤类型挑选参与融合的核心基因组合;(2)核心基因杂交捕获探针设计:对步骤(1)得到的核心基因进行叠瓦式全覆盖式探针设计;(3)测序文库构建:提取待测样本基因组DNA或转录组RNA,构建初始文库;(4)探针杂交捕获:合成步骤(2)得到的探针,与步骤(3)得到的初始文库进行杂交捕获反应;(5)高通量测序:对步骤(4)探针杂交捕获到的核心基因参与的融合基因进行高通量测序;(6)生物信息学分析:对测序数据进行筛选,得到融合基因检测结果。该方法快捷、高效、全面。
搜索关键词: 融合基因 核心基因 高通量测序 高效经济 探针杂交 构建 捕获 文库 检测 生物信息学分析 筛选 生物技术领域 杂交捕获探针 基因组DNA 测序数据 测序文库 待测样本 合成步骤 基因组合 检测结果 探针设计 杂交捕获 肿瘤类型 全覆盖 转录组 探针 融合
【主权项】:
1.一种检测融合基因的方法,其特征在于,该方法包括下述顺序的步骤:(1)核心基因筛选:针对肿瘤类型挑选参与融合的核心基因组合;(2)核心基因杂交捕获探针设计:对步骤(1)得到的核心基因进行叠瓦式全覆盖式探针设计;(3)测序文库构建:提取待测样本基因组DNA或转录组RNA,构建初始文库;(4)探针杂交捕获:合成步骤(2)得到的探针,与步骤(3)得到的初始文库进行杂交捕获反应;(5)高通量测序:对步骤(4)探针杂交捕获到的核心基因参与的融合基因进行高通量测序;(6)生物信息学分析:对测序数据进行筛选,得到融合基因检测结果。
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