[发明专利]快速检测汉赛巴尔通体的引物及制备方法和试剂盒在审
申请号: | 201810044923.5 | 申请日: | 2018-01-17 |
公开(公告)号: | CN108165644A | 公开(公告)日: | 2018-06-15 |
发明(设计)人: | 孟庆玲;乔军;李重阳;乔梦凡;伍晔晖;孟丹;贡莎莎;王熙凤;李静;张凯;田路路;张星星;张再超 | 申请(专利权)人: | 石河子大学 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/04;C12N15/11;C12Q1/6844;G01N33/569;C12Q1/6806;C12R1/01 |
代理公司: | 石河子恒智专利商标代理事务所(普通合伙) 65102 | 代理人: | 李伯勤 |
地址: | 832000 新疆维吾尔*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | 本发明公开了一种本发明涉及一种汉赛巴尔通体基因组DNA可视化快速检测方法的建立,属生物技术领域,筛选出1对特异性高、敏感性强的RPA引物,即上游引物<210>2和上游引物<210>2,建立了检测Bh基因组DNA的RPA检测体系。与常规PCR方法相比,RPA‑LFA具有对仪器设备要求低(只需要一个恒温水浴锅)、检测速度快(约40min)、检测结果的可视化(可以直接用肉眼观察检测结果)等优点,这些优点使得本发明建立的RPA‑LFA方法可以用于宠物医院猫Bh感染的快速检测和诊断。 1 | ||
搜索关键词: | 快速检测 基因组DNA 巴尔通体 检测结果 上游引物 可视化 引物 检测 生物技术领域 恒温水浴锅 宠物医院 仪器设备 常规PCR 试剂盒 制备 筛选 诊断 感染 | ||
主要通过下列步骤制备:
Bh基因组DNA的制备,取Bh对数生长期培养物收集菌体,菌体用TE缓冲液悬浮后,用细菌基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA,测定提取DNA的浓度及纯度,待用;
Bh RPA引物的设计与合成,下载GenBank公布的Bh不同分离株gltA基因,通过Blast N和DNAMAN软件对Bh gltA基因进行序列比对,筛选高度保守的序列作为扩增的靶序列,设计若干对特异性引物,通过试验筛选出具有高特异性和敏感性的检测RPA引物;
RPA反应体系的配制及操作程序,配制RPA反应体系,进行RPA反应,
RPA最佳引物的筛选,以Bh基因组DNA为模板,分别用若干对Bh RPA引物进行RPA扩增,随后用对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据特异性、敏感性和产物量筛选出RPA最佳引物。
3.根据权利要求1或2所述的快速检测汉赛巴尔通体的引物,其特征在于,将所述的引物制备成胶体金标抗体:采用柠檬酸三钠还原法制备胶体金溶液,向其中加入兔抗地高辛抗体IgG,恒温缓慢振荡并离心处理,弃去上清液,沉淀溶解于Tris‑HCL缓冲溶液中,得到胶体金标记的兔抗地高辛抗体IgG。
4.一种快速检测汉赛巴尔通体的试剂,其特征在于,根据权利要求1或2所述的引物制备。5.一种快速检测汉赛巴尔通体的试剂盒,其特征在于,根据权利要求3所述的到胶体金标记的兔抗地高辛抗体IgG制备,所述试剂盒至少包含以下5个部分:加样垫、结合垫、吸收垫、NC膜和PVC塑料垫,所述的NC膜上设有检测线即T线和质控线即C线,其制备过程为:将制备的胶体金标记兔抗地高辛抗体IgG用移液枪均匀滴加喷到NC膜上,放在真空干燥箱中干燥后取出,作为结合垫,
在NC膜上,检测线(T线)上包被经PBS缓冲液稀释的链霉亲和素,质控线上包被羊抗兔IgG,干燥,组装的顺序依次为:在PVC塑料垫的中间区域先贴上NC膜,结合垫贴在NC膜的前方区域,为保证良好的接触,结合垫压NC膜1.5‑2.5mm,再在结合垫的前方贴上样品垫,样品垫压结合垫1.5‑2.5mm,最后将吸水垫贴在NC膜的后方,吸水垫压NC膜1.5‑2.5mm,将试纸板切切割为3.5‑4.5mm的试纸条,将制备好的试纸条包装。
6.一种快速检测汉赛巴尔通体的引物及该引物的制备方法,其特征在于,主要包含下列步骤:Bh基因组DNA的制备:取Bh对数生长期培养物于离心管,离心处理,收集菌体,弃上清,菌体用TE缓冲液悬浮后,用细菌基因组DNA提取试剂盒提取基因组DNA,测定提取DNA的浓度及纯度,待用;
Bh RPA引物的设计与合成:下载GenBank公布的Bh不同分离株gltA基因,通过Blast N和DNAMAN软件对Bh gltA基因进行序列比对,筛选高度保守的序列作为扩增的靶序列,参考RPA引物设计的基本原则,设计若干对特异性引物,通过试验筛选出具有高特异性和敏感性的检测RPA引物;
RPA反应:配制RPA反应体系,包括RPA‑FP、RPA‑RPL、Rehydration Buffer μL、dd H2O、模板和MgAc,将模板和MgAc之外的所有试剂预混后,转入预添加exo冻干酶制剂的PCR反应管中,并充分混匀,将模板加入反应管中,并将MgAc加在反应管盖中,盖紧后瞬时离心并涡旋后,放入38‑42℃水浴锅中进行RPA反应35‑45min;
RPA最佳引物的筛选:以Bh基因组DNA为模板,分别用若干对Bh RPA引物进行RPA扩增,随后用对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,根据特异性、敏感性和产物量筛选出RPA最佳引物。
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