[发明专利]一种全基因组甲基化高通量测序方法在审
申请号: | 201810035958.2 | 申请日: | 2018-01-15 |
公开(公告)号: | CN108034705A | 公开(公告)日: | 2018-05-15 |
发明(设计)人: | 李泽卿 | 申请(专利权)人: | 武汉爱基百客生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | 本发明公开了一种全基因组甲基化高通量测序方法,包括如下步骤:将基因组测序样本,连接上CCGG位点的接头,随后用MmeI酶切,在用连接酶连接上基因组测序样本上的第二个接头,将扩增后的基因组测序样本使用PTP平板,且测序模板表面放置有ATP硫化酶以及荧光素酶,测序开始时,A、T、C、G四种碱基依照固定顺序依次循环进行入PTP平板,在ATP硫化酶的作用下,生成的PPi和磷酰硫酸结合形成ATP,在荧光素酶的催化下,生成的ATP和荧光素结合形成氧化荧光素,在反应所释放的光信号被高灵敏度的CCD捕获,并生成测序图像。本发明能够对基因组进行准确的测序,能够将基因组序列显示在我们眼前。 | ||
搜索关键词: | 一种 基因组 甲基化 通量 方法 | ||
【主权项】:
1.一种全基因组甲基化高通量测序方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:选取基因组,并利用限制性内切酶对基因组进行酶切,以便获得基因组片段,并将获取的基因组片段置于零下15-零下8摄氏度的条件下进行放置,放置环境需为无菌环境;S2:在放置36-48h后,将基因组片段取出,并置于5-8摄氏度的环境中,然后将所述基因组片段进行末端修复,以便获得经过末端修复的基因组片段,修复后的基因组片段再次放置在器皿内,并向器皿内添加亚硫酸盐,且亚硫酸盐需漫过基因组片段,并对基因组片段进行实时晃动,从而使其均匀接触,待其放置4-7min后,则完成对基因组片段的修饰,从而形成基因组测序样本;S3:将S2中形成的基因组测序样本,对样本上的CCGG位点进行确定,然后连接上CCGG位点的接头,随后用MmeI酶切,可得到一段包含HpaII酶切位点的18-19bp的标签序列,在用连接酶连接上基因组测序样本上的第二个接头,然后对其进行扩增,且扩增的温度为25-35摄氏度;S4:将S3中扩增后的基因组测序样本使用PTP平板,且PTP平板含有160万个光纤孔,在测序反应中,每个光纤孔内都固定有测序模板,且测序模板表面放置有ATP硫化酶以及荧光素酶,测序开始时,A、T、C、G四种碱基依照固定顺序依次循环进行入PTP平板,且每次只进入一个碱基,在ATP硫化酶的作用下,生成的PPi和磷酰硫酸结合形成ATP,在荧光素酶的催化下,生成的ATP和荧光素结合形成氧化荧光素,同时产生可见光;S5:在S4中反应所释放的光信号被高灵敏度的CCD捕获,并生成测序图像,从而获得待测模板的测序信息。
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