[发明专利]一种玉米全基因组SNP芯片及其应用有效
| 申请号： | 201711382711.X | 申请日： | 2017-12-20 |
| 公开（公告）号： | CN108004344B | 公开（公告）日： | 2020-11-03 |
| 发明（设计）人： | 付俊杰;王国英;何骋;郝杨凡;张红伟;李莉 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院作物科学研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君;王璐 |
| 地址： | 100081 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及分子生物学和基因组育种领域，具体公开了一种玉米全基因组SNP芯片及其应用。本发明收集了覆盖基因表达区域的SNP位点及全基因组均匀分布的SNP位点，筛选后制备了高通量Illumina的Infinium SNP芯片，包括检测表1所示的500个SNP标记的探针。本发明所选择的SNP位点基于大规模测序结果，获得了频率分布合理、缺失率低、假阳性低的特异信号；其中2/3的SNP位点在玉米温带和热带材料中均有分布，可以有效用于热带材料的选择和利用；其中426个SNP位点为功能标记，与籽粒物质积累基因表达显著关联；Illumina的Infinium平台具有SNP分型检出率高、重复率高、检测简便、准确性好的特点。可用于玉米种质资源分子标记指纹分析，玉米连锁图谱构建和QTL定位以及玉米育种材料背景选择等。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 玉米 基因组 snp 芯片 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种玉米SNP标记组合，其特征在于，由表1所示的500个SNP标记组成，所述SNP标记是指表1序列中方括号([])中的核苷酸。
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