[发明专利]接种菌剂玉米的根际原核微生物多样性检测方法在审
| 申请号： | 201711164517.4 | 申请日： | 2017-11-21 |
| 公开（公告）号： | CN109811044A | 公开（公告）日： | 2019-05-28 |
| 发明（设计）人： | 周培;初少华;张丹;支月娥;王斌;戚志萍 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人： | 王毓理;王锡麟 |
| 地址： | 200240 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 一种接种菌剂玉米的根际原核微生物多样性检测方法，通过从种植有玉米幼苗的根际土壤中提取宏基因组DNA，通过PCR扩增其中的16SrDNA的V4V5高变区片段以构建文库；经过双端测序后进行分类学单元分类，与文库进行对比和注释，最后通过根际土壤原核微生物的群落结构分析，比较不同处理之间的异同，具体为：Alpha多样性分析、分类学组成分析和Beta多样性分析，得到微生物群体分类。本发明为巨大芽孢杆菌菌剂对根际土壤原核微生物群落影响的准确评估提供了一种新方法。 | ||
| 搜索关键词： | 原核微生物 根际土壤 多样性分析 多样性检测 接种菌剂 根际 文库 巨大芽孢杆菌 微生物群体 单元分类 宏基因组 群落结构 玉米幼苗 准确评估 玉米 高变区 测序 构建 菌剂 双端 分析 分类 种植 | ||
【主权项】：
1.一种接种菌剂玉米的根际原核微生物多样性检测方法，其特征在于，通过从种植有玉米幼苗的根际土壤中提取宏基因组DNA，通过PCR扩增其中的16SrDNA的V4V5高变区片段以构建文库；经过双端测序后进行分类学单元分类，与文库进行对比和注释，最后通过根际土壤原核微生物的群落结构分析，比较不同处理之间的异同，具体为：Alpha多样性分析、分类学组成分析和Beta多样性分析，得到微生物群体分类；所述的土壤，其中含有不同硝态氮浓度且施加有巨大芽孢杆菌NCT‑2菌剂；所述的巨大芽孢杆菌NCT‑2菌剂，通过将58.9％的巨大芽孢杆菌NCT‑2发酵液与23.5％的秸秆粉和17.6％的葡萄糖混匀得到。
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