[发明专利]一种基于总DNA测序结果的细胞器基因组筛选方法在审
| 申请号： | 201710972615.4 | 申请日： | 2017-10-18 |
| 公开（公告）号： | CN107784199A | 公开（公告）日： | 2018-03-09 |
| 发明（设计）人： | 刘源;高立志 | 申请（专利权）人： | 中国科学院昆明植物研究所 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18;G06F19/20;G06F19/22 |
| 代理公司： | 昆明协立知识产权代理事务所(普通合伙)53108 | 代理人： | 旃习涵 |
| 地址： | 650201 *** | 国省代码： | 云南;53 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种基于总DNA测序结果的细胞器基因组筛选方法及应用。具体地，本发明通过设计的算法对植物总DNA测序获得的核苷酸序列和已发表的细胞器基因组(叶绿体/线粒体)进行比较分析，筛选出其中的细胞器核苷酸序列，并用开源基因组拼接软件对筛选的结果进行De novo组装，获得细胞器基因组的框架图，然后通过实验的方法填补少量Gaps，最后获得完整的细胞器基因组。同时本发明通过PCR(聚合酶链式反应技术)实验验证了组装结果的可行性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 dna 结果 细胞器 基因组 筛选 方法 | ||
【主权项】：
一种基于总DNA测序结果的细胞器基因组筛选方法，其特征在于该方法是通过设计的算法对植物总DNA测序获得的核苷酸序列和已发表的细胞器叶绿体/线粒体基因组进行比较分析，筛选出其中的细胞器核苷酸序列，并用开源基因组拼接软件对筛选的结果进行De novo组装，获得细胞器基因组的框架图，然后通过实验的方法填补少量Gaps，最后获得完整的细胞器基因组，同时通过PCR聚合酶链式反应技术实验验证组装结果的可行性。
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