[发明专利]用于多重核酸测序的标签和引物有效
申请号: | 201610645098.5 | 申请日: | 2016-08-08 |
公开(公告)号: | CN106282332B | 公开(公告)日: | 2019-11-15 |
发明(设计)人: | 王绪敏;刘贵明;赵倍伦;宋利璞;于军 | 申请(专利权)人: | 中国科学院北京基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12Q1/04;C12N15/11;C40B50/06 |
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地址: | 101000北京市朝阳区北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及分子生物学技术领域,具体涉及用于多重核酸测序的标签和用于构建真菌ITS序列多重测序文库的PCR引物。本发明提供的Index经过庞大数量的实际测序检验,将其包含于测序或建库引物后,混合测序反应得到的测序数据平衡性相对较好,进而能够更加真实可靠地反应样品中的真菌组成情况。本发明提供的用于构建真菌ITS序列多重测序文库的PCR引物比现有的常规ITS引物的特异性更高,不仅能够对动物肠道、水体以及大曲等复杂性相对较低的样品类型获得高特异的扩增产物;对土壤和淤泥等高复杂性的样品类型也具有较高的特异性,因此保障了后续测序结果的准确性,进而能够获得相对更加准确的分析结果和更加真实的真菌组成情况。 | ||
搜索关键词: | 测序 测序文库 样品类型 真菌组成 真菌 构建 分子生物学技术 大曲 测序数据 动物肠道 反应样品 核酸测序 混合测序 扩增产物 平衡性 等高 建库 引物 淤泥 水体 标签 土壤 检验 | ||
【主权项】:
1.一组用于构建土壤样品中真菌ITS序列多重测序文库的PCR引物,其特征在于:所述的一组PCR引物包括正向引物组和反向引物组;/n所述的正向引物组由以下引物组成:/n引物F1:其序列为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,其中含有Index1:ACGATGCT;/n引物F2:其序列为SEQ ID NO:2所示的核苷酸序列,其中含有Index2:AGACTGTC;/n引物F3:其序列为SEQ ID NO:3所示的核苷酸序列,其中含有Index3:AGCATCGT;/n引物F7:其序列为SEQ ID NO:7所示的核苷酸序列,其中含有Index7:ATCGTAGC;/n引物F8:其序列为SEQ ID NO:8所示的核苷酸序列,其中含有Index8:CAGACTGT;/n引物F9:其序列为SEQ ID NO:9所示的核苷酸序列,其中含有Index9:CGATGCTA;/n引物F12:其序列为SEQ ID NO:12所示的核苷酸序列,其中含有Index12:CGTAGCAT;/n引物F13:其序列为SEQ ID NO:13所示的核苷酸序列,其中含有Index13:CTACGATG;/n引物F14:其序列为SEQ ID NO:14所示的核苷酸序列,其中含有Index14:GACAGTCT;/n引物F23:其序列为SEQ ID NO:23所示的核苷酸序列,其中含有Index23:GCATCGTA;/n所述的反向引物组由以下引物组成:/n引物R15:其序列为SEQ ID NO:44所示的核苷酸序列,其中含有Index15:CTCTGCCT;/n引物R17:其序列为SEQ ID NO:46所示的核苷酸序列,其中含有Index17:CCTACTAT;/n引物R18:其序列为SEQ ID NO:47所示的核苷酸序列,其中含有Index18:CGATGCTG;/n引物R19:其序列为SEQ ID NO:48所示的核苷酸序列,其中含有Index19:ATGCTAAT;/n引物R21:其序列为SEQ ID NO:50所示的核苷酸序列,其中含有Index21:GCGTCTAT;/n引物R25:其序列为SEQ ID NO:54所示的核苷酸序列,其中含有Index25:GGAGTCCT;/n引物R26:其序列为SEQ ID NO:55所示的核苷酸序列,其中含有Index26:GCTCGAGC;/n引物R27:其序列为SEQ ID NO:56所示的核苷酸序列,其中含有Index27:AAGGCATA;/n引物R28:其序列为SEQ ID NO:57所示的核苷酸序列,其中含有Index28:ACTGCGGA;/n引物R29:其序列为SEQ ID NO:58所示的核苷酸序列,其中含有Index29:AGGCGCTA。/n
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