[发明专利]茄子高温胁迫内参基因及其应用

摘要

本发明公开了茄子高温胁迫内参基因及其应用。本发明基于正常生长条件和高温胁迫6h条件下的热敏和耐热茄子幼苗叶片转录组RNA‑Seq数据，从中找到8个候选内参基因。以SmActin为对照，对8个候选内参基因在热敏和耐热茄子品系高温胁迫不同时间、不用组织的实验材料中进行实时荧光定量PCR（qPCR）分析，采用GeNorm、NormFinder、Bestkeeper和ReFinder软件对qPCR结果进行分析，最终得到了在茄子正常生长温度和高温胁迫下不同时间和不同组织中最稳定表达的3个内参基因—Sm EF 1A、Sm TRX、Sm UCP。本发明首次针对茄子耐热性研究借助RNA‑Seq数据对内参基因进行筛选，有利于提高茄子高温胁迫条件下基因表达分析研究的稳定性和可靠性。

主权项

茄子高温胁迫内参基因，其为茄子转录延伸因子EF 1A基因、转录延伸因子EF2基因、核糖体蛋白RPL24基因、核糖体蛋白RPS29基因、硫氧还蛋白TRX基因、酪蛋白激酶基因、DAHP合酶基因或Unigene0048390基因；所述转录延伸因子EF 1A基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述转录延伸因子EF2基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，核糖体蛋白RPL24基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示，核糖体蛋白RPS29基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示，硫氧还蛋白TRX基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示，酪蛋白激酶基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示，DAHP合酶基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示，Unigene0048390基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示。