[发明专利]能检测多种新生儿遗传病的RNA探针及基因筛查试剂盒在审
申请号: | 201510122883.8 | 申请日: | 2015-03-19 |
公开(公告)号: | CN104673925A | 公开(公告)日: | 2015-06-03 |
发明(设计)人: | 洪旭涛;余文菁;谭海芹 | 申请(专利权)人: | 绍兴锐创生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 312071 浙江省绍兴市袍*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供能同时检测多种新生儿遗传病的RNA探针、以及提供相应的能对多种新生儿遗传代谢疾病体外定性检测的方法,本发明的检测方法旨在降低检测成本。具体而言,本发明公开了一种能同时检测多种新生儿遗传病的RNA探针,RNA探针的设计方法包括如下步骤:1)、获得新生儿遗传代谢疾病所对应基因的外显子区域;2)、制定寡核苷酸设计原则。本发明的1760条寡核苷酸序列具体如表1所示。本发明还同时提供含有上述RNA探针的试剂盒,该试剂盒能同时检测多种新生儿遗传病。 | ||
搜索关键词: | 检测 多种 新生儿 遗传病 rna 探针 基因 试剂盒 | ||
【主权项】:
能同时检测多种新生儿遗传病的RNA探针,其特征是:RNA探针的设计方法包括如下步骤:1)、获得新生儿遗传代谢疾病所对应基因的外显子区域;2)、制定寡核苷酸设计原则:①、每种基因不同转录本,通过位置信息均映射到HG19人类标准参考基因组上,选取能覆盖所有转录本的序列;②、设计探针时,避开RefSeq,Ensembl,CCDS,Gencode,VEGA,SNP,CytoBand数据库中的突变、SNP或插入缺失位点;③、外显子部分向3’和5’端的内含子中各沿伸10bp;④、每个探针至少有50%以上的重叠,探针CG含量在40%-60%之间的覆盖2倍;CG含量低于40%或高于60%的,覆盖3倍;每条寡核苷酸序列包括三部分:5’末端21bp通用序列、120bp能与基因特异性结合的序列、3’末端21bp通用序列;5’通用序列:gtccgaatcgcaccagcgtgttgt3’通用序列:gagtgcggctcctcatcgagcagg。
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