[发明专利]能检测多种新生儿遗传病的RNA探针及基因筛查试剂盒在审
申请号: | 201510122883.8 | 申请日: | 2015-03-19 |
公开(公告)号: | CN104673925A | 公开(公告)日: | 2015-06-03 |
发明(设计)人: | 洪旭涛;余文菁;谭海芹 | 申请(专利权)人: | 绍兴锐创生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 312071 浙江省绍兴市袍*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 多种 新生儿 遗传病 rna 探针 基因 试剂盒 | ||
1.能同时检测多种新生儿遗传病的RNA探针,其特征是:RNA探针的设计方法包括如下步骤:
1)、获得新生儿遗传代谢疾病所对应基因的外显子区域;
2)、制定寡核苷酸设计原则:
①、每种基因不同转录本,通过位置信息均映射到HG19人类标准参考基因组上,选取能覆盖所有转录本的序列;
②、设计探针时,避开RefSeq,Ensembl,CCDS,Gencode,VEGA,SNP,CytoBand数据库中的突变、SNP或插入缺失位点;
③、外显子部分向3’和5’端的内含子中各沿伸10bp;
④、每个探针至少有50%以上的重叠,探针CG含量在40%-60%之间的覆盖2倍;CG含量低于40%或高于60%的,覆盖3倍;
每条寡核苷酸序列包括三部分:5’末端21bp通用序列、120bp能与基因特异性结合的序列、3’末端21bp通用序列;
5’通用序列:gtccgaatcgcaccagcgtgttgt
3’通用序列:gagtgcggctcctcatcgagcagg。
2.根据权利要求1所述的能同时检测多种新生儿遗传病的RNA探针,其特征是:1760条寡核苷酸序列如表1所示:
表1
3.含有如权利要求1或2所述的RNA探针的试剂盒,其特征是:该试剂盒能同时检测多种新生儿遗传病。
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