[发明专利]用于扩增细菌DNA的PCR中使用的引物组及其试剂盒和方法

摘要

本发明的目的在于，提供对于进一步提高利用PCR法检出或鉴定被检样品中的细菌菌种的灵敏度有用的引物组，使用了其的用于PCR的试剂盒及检出或鉴定被检样品中的细菌菌种的方法，以及通过使细菌来源的核酸的混入量为最小限度、并进行使用了上述的引物组的PCR法，从而达成检出或鉴定被检样品中的细菌菌种的方法的灵敏度的进一步的提高。为了达成上述目的，本发明涉及的用于扩增细菌DNA的PCR中使用的引物组包含：从包含特定的引物对的第S1组～第S7组的各组中分别选择1对引物对而得到的7对引物对中的至少1对引物对。此外，本发明涉及的用于检出细菌菌种的试剂盒包含：从包含特定的引物对的第K1组～第K7组的各组中分别选择1对引物对而得到的7对引物对中的至少1对引物对。

主权项

用于扩增细菌DNA的PCR中使用的引物组，其特征在于，其包含：从下述第S1组～第S7组的各组中分别选择1对引物对而得到的7对引物对中的至少1对引物对；第S1组：1－1A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号1的序列，所述反向引物包含序列号22及27中的任一序列，1－2A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号10的序列，所述反向引物包含序列号20及21中的任一序列，1－3A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号11的序列，所述反向引物包含序列号16、18及26中的任一序列，1－4：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号12的序列，所述反向引物包含序列号16～27中的任一序列，1－5：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号13的序列，所述反向引物包含序列号16～27中的任一序列，1－7：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号15的序列，所述反向引物包含序列号16～27中的任一序列，1－8A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号6的序列，所述反向引物包含序列号16、19～21、23、24、26及27中的任一序列，1－9A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号7的序列，所述反向引物包含序列号16～21、23、24、26及27中的任一序列，或1－10A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号8的序列，所述反向引物包含序列号16～21、23、24、26及27中的任一序列，第S2组：2－1A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号28的序列，所述反向引物包含序列号45及47～50中的任一序列，2－2：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号29的序列，所述反向引物包含序列号44、45、47、48及50中的任一序列，2－3：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号30的序列，所述反向引物包含序列号45及47～50中的任一序列，2－4：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号31的序列，所述反向引物包含序列号46及47中的任一序列，2－5：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号32的序列，所述反向引物包含序列号45及47～49中的任一序列，2－6A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号33的序列，所述反向引物包含序列号44、45及47～50中的任一序列，2－7A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号34的序列，所述反向引物包含序列号45、47及48中的任一序列，2－8A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号35的序列，所述反向引物包含序列号44、45、48及49中的任一序列，2－9A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号36的序列，所述反向引物包含序列号44、45、48及49中的任一序列，2－10A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号37的序列，所述反向引物包含序列号45及47～50中的任一序列，2－11：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号38的序列，所述反向引物包含序列号44～50中的任一序列，2－12A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号39的序列，所述反向引物包含序列号44～48及50中的任一序列，2－13：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号40的序列，所述反向引物包含序列号44～50中的任一序列，2－14A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号41的序列，所述反向引物包含序列号45及46中的任一序列，2－15A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号42的序列，所述反向引物包含序列号48及49中的任一序列，或2－16A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号43的序列，所述反向引物包含序列号44、46～48及50中的任一序列，第S3组：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号51的序列，所述反向引物包含序列号52的序列，第S4组：4－1：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号53的序列，所述反向引物包含序列号57～61中的任一序列，4－2：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号54的序列，所述反向引物包含序列号59及61中的任一序列，4－3：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号55的序列，所述反向引物包含序列号57～59及61中的任一序列，或4－4：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号56的序列，所述反向引物包含序列号57～59及61中的任一序列，第S5组5－1A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号62的序列，所述反向引物包含序列号70、73～75中的任一序列，5－2：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号63的序列，所述反向引物包含序列号70～75中的任一序列，5－3：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号64的序列，所述反向引物包含序列号70～75中的任一序列，5－4：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号65的序列，所述反向引物包含序列号70～75中的任一序列，5－5A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号66的序列，所述反向引物包含序列号70、72、73及75中的任一序列，5－6A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号67的序列，所述反向引物包含序列号70、71及73～75中的任一序列，5－7：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号68的序列，所述反向引物包含序列号70～75中的任一序列，或5－8：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号69的序列，所述反向引物包含序列号70～75中的任一序列，第S6组6－1A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号76的序列，所述反向引物包含序列号93、96及101～103中的任一序列，6－2：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号77的序列，所述反向引物包含序列号91、96及101～103中的任一序列，6－3：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号78的序列，所述反向引物包含序列号91及101～103中的任一序列，6－4A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号79的序列，所述反向引物包含序列号91及101～103中的任一序列，6－5：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号80的序列，所述反向引物包含序列号91、93及100～103中的任一序列，6－6：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号81的序列，所述反向引物包含序列号91、93及101～103中的任一序列，6－7：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号82的序列，所述反向引物包含序列号91、96、97及101～103中的任一序列，6－8：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号83的序列，所述反向引物包含序列号91、101～103中的任一序列，6－9：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号84的序列，所述反向引物包含序列号91及101～103中的任一序列，6－10：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号85的序列，所述反向引物包含序列号91及101～103中的任一序列，6－11A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号86的序列，所述反向引物包含序列号91、93及101～103中的任一序列，6－12：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号87的序列，所述反向引物包含序列号91、96及101～103中的任一序列，6－13：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号88的序列，所述反向引物包含序列号91及101～103中的任一序列，6－14：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号89的序列，所述反向引物包含序列号91及101～103中的任一序列，或6－15：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的分别的组合，所述正向引物包含序列号90的序列，所述反向引物包含序列号91、92、96及101～103中的任一序列，第S7组7－1A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号104的序列，所述反向引物包含序列号5及118～125、127、128、130及131中的任一序列，7－2A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号105的序列，所述反向引物包含序列号5及118～125中的任一序列，7－3A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号106的序列，所述反向引物包含序列号2、5及116及118～131中的任一序列，7－4A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号107的序列，所述反向引物包含序列号120及121中的任一序列，7－5A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号108的序列，所述反向引物包含序列号120及123中的任一序列，7－6A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号109的序列，所述反向引物包含序列号2、118～122、124及126中的任一序列，7－7A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号110的序列，所述反向引物包含序列号118、120、121、124及126～130中的任一序列，7－8A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号111的序列，所述反向引物包含序列号2、5及118～131中的任一序列，7－9A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号112的序列，所述反向引物包含序列号2、5及116、及118～125中的任一序列，7－10A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号113的序列，所述反向引物包含序列号2、5、118～126、130及131中的任一序列，7－11A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号114的序列，所述反向引物包含序列号5的序列，或7－12A：引物对，其包含下述正向引物和反向引物的组合，所述正向引物包含序列号115的序列，所述反向引物包含序列号2及5中的任一序列。