[发明专利]用于基因组组装及单体型定相的方法有效
| 申请号： | 201480020008.2 | 申请日： | 2014-01-31 |
| 公开（公告）号： | CN105121661B | 公开（公告）日： | 2018-06-08 |
| 发明（设计）人： | 小R·E·格林;L·F·拉里奥 | 申请（专利权）人： | 加利福尼亚大学董事会 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 | 代理人： | 陈建芳;阎娬斌 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 本发明提供了用于大大加快并改善从头基因组组装的方法。本文所公开的方法利用数据分析方法，使来自一个或多个受试者的基因组的从头组装快速且便宜。本发明进一步提供，本文所公开的方法可用于多种应用，包括单体型定相和宏基因组分析。 | ||
| 搜索关键词： | 基因组 组装 单体型 宏基因组分析 数据分析 可用 应用 | ||
【主权项】：
一种用于基因组组装的方法，其包括：获得多个重叠群；获得重构染色质，所述重构染色质包含与分离的核蛋白复合的裸DNA；从通过探测重构染色质的物理布局产生的数据中，生成多个读对；将所述多个读对定位至所述多个重叠群，从而产生读段定位数据；使用所述读段定位数据排列所述重叠群；以及确定经过所述重叠群的路径，所述路径代表所述重叠群的次序和/或朝着基因组的方向。
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