[发明专利]利用单核酸多型性标记组合鉴别猪只免疫特性的方法及其应用

摘要

本发明涉及一种利用单核酸多型性标记组合鉴别猪只免疫特性的方法，其由多个猪只血液样本分离出的周边血液细胞取得多个免疫表型分型资料与多个单核苷酸多型性(SNP)标记的组合，建立相关性模式，由此定量且定性鉴别待测样本的免疫特性。本发明方法可应用在多品系猪只中，选育出具有所需免疫特性的亲代或预测其子代的免疫特性。

主权项

1.一种分析多个免疫相关基因与多个单核酸多型性标记组合的相关性的方法，所述方法用于非诊断目的，其特征在于包含：建立一相关性模式，包含：由多个猪只血液样本分离出多个第一周边血液细胞，以获得多个第一核酸样本，其中该些第一周边血液细胞为周边血液单核细胞；利用SEQ ID NO.：1‑6、14‑16、28‑30、33‑38、66‑68、72‑74、90‑92、99‑100、104‑106所示的引物进行扩增受阻突变系统聚合酶链反应，以由该些第一核酸样本扩增并获得多个第一核酸片段，该些第一核酸片段包含多个第一单核苷酸多型性资料，其中该些第一单核苷酸多型性资料包括多个单核苷酸多型性位点、该些单核苷酸多型性位点的每一个的多个基因型以及对应的多个第一系数值，该些基因型包括两种或三种，且该些单核苷酸多型性位点包括干扰素‑α的多型性位点：Genbank:X57191‑235位、干扰素‑γ的多型性位点：Genbank:X53085 382位、肿瘤坏死因子‑α的多型性位点：Genbank:NC_010449 1219位、单核细胞趋化蛋白‑1的多型性位点：Genbank:CU928660273位、单核细胞趋化蛋白‑1的多型性位点：Genbank:CU928660 351位、单核细胞趋化蛋白‑1的多型性位点：Genbank:CU928660 360位、单核细胞趋化蛋白‑1的多型性位点：Genbank:CU928660 383位、类铎受体7的多型性位点：Genbank:AB291813 1633位、类铎受体7的多型性位点：Genbank:AB291813 22996位、类铎受体8的多型性位点：Genbank:AB291813 534位、类铎受体9的多型性位点：Genbank:CPU915558 905位以及类铎受体9的多型性位点：Genbank:CPU915558 1186位，该些基因型依照碱基优先级A、T、C、G的较前者并具有纯合子之一，该第一系数值为1，且其余的该些基因型的该第一系数值为0；获得该些猪只的多个免疫表型分型资料，其中该些免疫表型分型资料定义多个免疫特性，且该些免疫特性包括一细胞增殖率以及多个免疫相关基因的多个表达量，该细胞增殖率为细胞刺激指数，该细胞表面抗原阳性率包括MHCI抗原阳性率、MHCII抗原阳性率以及CD80/86的表达比；以及根据一多变量复回归算法，通过该些免疫表型分型资料以及该些第一单核苷酸多型性资料，建立该相关性模式，以定义该些免疫特性的任一种与对应的该些单核苷酸多型性位点的至少两者的关系式；以及利用该相关性模式鉴别待测样本的免疫特性，包含：由该待测样本的一第二周边血液细胞获得一第二核酸样本，其中该第二周边血液细胞为周边血液单核细胞；利用SEQ ID NO.：1‑6、14‑16、28‑30、33‑38、66‑68、72‑74、90‑92、99‑100、104‑106所示的该引物进行該扩增受阻突变系统聚合酶链反应，以由该第二核酸样本扩增并获得多个第二核酸片段，该些第二核酸片段包含多个第二单核苷酸多型性资料，其中该些第二单核苷酸多型性资料包括该些单核苷酸多型性位点的该些基因型以及多个对应的系数值；将该些第二单核苷酸多型性资料输入该相关性模式，以判断该些第二单核苷酸多型性资料是否与该些关系式之一相符，并获得对应的显著性差异值；以及当该些第二单核苷酸多型性资料之一与该些第一单核苷酸多型性资料对应的该些关系式之一相符，且对应的该显著性差异值小于0.05时，判断该待测样本具有该关系式对应的该些免疫特性之一。