[发明专利]一种检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法及试剂盒有效
申请号: | 201410188272.9 | 申请日: | 2014-05-06 |
公开(公告)号: | CN103981284A | 公开(公告)日: | 2014-08-13 |
发明(设计)人: | 王洪梅;何洪彬 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院奶牛研究中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 彭成 |
地址: | 250100 山东省*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: |
本发明公开了一种检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法:(1)采集气溶胶样本;(2)提取气溶胶样本中病毒的cDNA;(3)检测:进行PCR扩增;(4)建立标准曲线和溶解曲线:建立阳性标准质粒的标准曲线,以及扩增体系的溶解曲线;(5)判断气溶胶样本中是否含有口蹄疫病毒。本发明还公开了特异性引物(如SEQ ID NO.1~8所示)以及试剂盒(由特异性引物、RT反应缓冲液、AMV反转录酶、 |
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搜索关键词: | 一种 检测 气溶胶 口蹄疫病毒 方法 试剂盒 | ||
【主权项】:
一种检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:步骤如下:(1)采集气溶胶样本;(2)提取气溶胶样本中病毒的cDNA;(3)检测:以上述提取的cDNA为模板,采用试剂盒进行SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR,具体如下:所述试剂盒由特异性引物、RT反应缓冲液、AMV反转录酶、
Premix Ex TaqTM II、标准阳性质粒、无RNase的水组成;所述标准阳性质粒包括阳性质粒pEASY‑T3‑5’UTR、pEASY‑T3‑O‑VP1、pEASY‑T3‑A‑VP1和pEASY‑T3‑A1‑VP1;所述阳性质粒pEASY‑T3‑5’UTR是由SEQ ID NO.9所示序列的第28‑203位核苷酸的序列片段与pEASY‑T3载体相连接后得到的重组质粒;所述阳性质粒pEASY‑T3‑O‑VP1是由ID NO.10所示的序列片段与pEASY‑T3载体相连接后得到的重组质粒;所述阳性质粒pEASY‑T3‑A‑VP1是由SEQ ID NO.11所示的序列片段与pEASY‑T3载体相连接后得到的重组质粒;所述阳性质粒pEASY‑T3‑A1‑VP1是由SEQ ID NO.12所示的序列片段与pEASY‑T3载体相连接后得到的重组质粒;所述特异性引物选自口蹄疫病毒检测的通用引物对或/和O型、A型、Asia1型3种血清型口蹄疫病毒鉴别检测引物对;所述口蹄疫病毒检测的通用引物对的序列如下:引物1‑5’UTR‑F:5’‑CGTTGCACTCCACACTTAC‑3’;引物2‑5’UTR‑R:5’‑GACCAAGTAGGCGGAAAG‑3’;O型、A型、Asia1型3种血清型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:O型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:引物3‑O‑VP1F:5’‑GCAACTCAGGTCCAGAGGCGTC‑3’;引物4‑O‑VP1R:5’‑CAGTGTGTGAGCAGGGATCTGCATC‑3’;A型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:引物5‑A‑VP1F:5’‑AGACACAGGCTCAGCGACGTC‑3’;引物6‑A‑VP1R:5’‑GGCTGCACGCAAAAGGGCACCCACC‑3’;Asia1型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:引物7‑A1‑VP1F:5’‑GAAACTCAGACAGCCAGGCGGC‑3’;引物8‑A1‑VP1R:5’‑CGCAGACCGCAGCAGGCTCCAACC‑3’;(4)建立标准曲线和溶解曲线:建立阳性标准质粒的标准曲线,以及扩增体系的溶解曲线;(5)判断:当所用特异性引物为口蹄疫病毒检测的通用引物对时,若溶解曲线为S型曲线,则表明气溶胶样本中含有口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有口蹄疫病毒;当所用特异性引物为O型、A型、Asia1型3种血清型口蹄疫病毒鉴别检测引物对时,若对应于O型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的溶解曲线为S型,则表明气溶胶样本中含有O型口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有O型口蹄疫病毒;若对应于A型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的溶解曲线为S型,则表明气溶胶样本中含有A型口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有A型口蹄疫病毒;若对应于Asia1型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的溶解曲线为S型,则表明气溶胶样本中含有Asia1型口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有Asia1型口蹄疫病毒。
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