[发明专利]一种检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法及试剂盒有效
申请号: | 201410188272.9 | 申请日: | 2014-05-06 |
公开(公告)号: | CN103981284A | 公开(公告)日: | 2014-08-13 |
发明(设计)人: | 王洪梅;何洪彬 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院奶牛研究中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 彭成 |
地址: | 250100 山东省*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 气溶胶 口蹄疫病毒 方法 试剂盒 | ||
1.一种检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:步骤如下:
(1)采集气溶胶样本;
(2)提取气溶胶样本中病毒的cDNA;
(3)检测:以上述提取的cDNA为模板,采用试剂盒进行SYBRGreenⅠ实时荧光定量PCR,具体如下:
所述试剂盒由特异性引物、RT反应缓冲液、AMV反转录酶、Premix Ex TaqTM II、标准阳性质粒、无RNase的水组成;
所述标准阳性质粒包括阳性质粒pEASY-T3-5’UTR、pEASY-T3-O-VP1、pEASY-T3-A-VP1和pEASY-T3-A1-VP1;
所述阳性质粒pEASY-T3-5’UTR是由SEQ ID NO.9所示序列的第28-203位核苷酸的序列片段与pEASY-T3载体相连接后得到的重组质粒;
所述阳性质粒pEASY-T3-O-VP1是由ID NO.10所示的序列片段与pEASY-T3载体相连接后得到的重组质粒;
所述阳性质粒pEASY-T3-A-VP1是由SEQ ID NO.11所示的序列片段与pEASY-T3载体相连接后得到的重组质粒;
所述阳性质粒pEASY-T3-A1-VP1是由SEQ ID NO.12所示的序列片段与pEASY-T3载体相连接后得到的重组质粒;
所述特异性引物选自口蹄疫病毒检测的通用引物对或/和O型、A型、Asia1型3种血清型口蹄疫病毒鉴别检测引物对;
所述口蹄疫病毒检测的通用引物对的序列如下:
引物1-5’UTR-F:5’-CGTTGCACTCCACACTTAC-3’;
引物2-5’UTR-R:5’-GACCAAGTAGGCGGAAAG-3’;
O型、A型、Asia1型3种血清型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:
O型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:
引物3-O-VP1F:5’-GCAACTCAGGTCCAGAGGCGTC-3’;
引物4-O-VP1R:5’-CAGTGTGTGAGCAGGGATCTGCATC-3’;
A型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:
引物5-A-VP1F:5’-AGACACAGGCTCAGCGACGTC-3’;
引物6-A-VP1R:5’-GGCTGCACGCAAAAGGGCACCCACC-3’;
Asia1型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的序列如下:
引物7-A1-VP1F:5’-GAAACTCAGACAGCCAGGCGGC-3’;
引物8-A1-VP1R:5’-CGCAGACCGCAGCAGGCTCCAACC-3’;
(4)建立标准曲线和溶解曲线:建立阳性标准质粒的标准曲线,以及扩增体系的溶解曲线;
(5)判断:当所用特异性引物为口蹄疫病毒检测的通用引物对时,若溶解曲线为S型曲线,则表明气溶胶样本中含有口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有口蹄疫病毒;
当所用特异性引物为O型、A型、Asia1型3种血清型口蹄疫病毒鉴别检测引物对时,若对应于O型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的溶解曲线为S型,则表明气溶胶样本中含有O型口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有O型口蹄疫病毒;
若对应于A型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的溶解曲线为S型,则表明气溶胶样本中含有A型口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有A型口蹄疫病毒;
若对应于Asia1型口蹄疫病毒鉴别检测引物对的溶解曲线为S型,则表明气溶胶样本中含有Asia1型口蹄疫病毒;若溶解曲线为一条直线,则表明气溶胶样本中不含有Asia1型口蹄疫病毒。
2.根据权利要求1所述的检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:所述步骤(1)中,采集气溶胶样本的方法为:采用MS-1型多功能微生物采样器,以10mLpH值7.0的磷酸盐缓冲液为采样介质,按照12.5L/min的采样流量采集30min,收集气溶胶样本。
3.根据权利要求1所述的检测气溶胶中口蹄疫病毒的方法,其特征在于:所述步骤(2)中,提取cDNA的方法为:取2mL气溶胶样本,应用病毒RNA提取试剂盒提取总RNA;再应用反转录试剂盒进行反转录,获得cDNA。
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