[发明专利]用于评估RNA断裂的试验、方法和设备

摘要

本文描述了涉及进行细胞RNA的RNA断裂试验(RDA)的试验、方法和装置的各种实施方案，所述细胞RNA任选地响应于细胞毒性治疗，诸如化疗和/或放射治疗。该方法包括获得与任选在治疗之前或之后一个时间点上包含细胞RNA的特有生物样品相对应的至少一个电泳图谱数据集；从至少一个电泳图谱数据集的至少两个偏移区中确定特征值，所述偏移是由于治疗导致的；并且基于特征值组合，任选地确定RDA分数。

主权项

1.一种用于进行细胞RNA的RNA断裂试验的方法，其中所述方法包括：获得与包含细胞RNA的特有生物样品相对应的至少一个电泳图谱数据集；鉴定从用于所述特有生物样品的常用分析平台上的样品获得的所述至少一个电泳图谱数据集的标准样品；确定来自所述标准样品的18S峰和28S峰的标准保留时间；从所述至少一个电泳图谱数据集中确定特征的值，所述确定如下进行：利用两个识别范围和所述标准保留时间以容纳18S峰和28S峰的可能偏移，检测所述18S峰和28S峰，在限定所述18S峰和28S峰之后测定中间区和低C条带区，其中所述中间区在所测定的18S峰和28S峰之间，所述低C条带区是在所述18S峰下方且邻近所述18S峰的低条带区的上部分，并至少部分基于经定位的18S峰和28S峰以及所述中间区面积和低C条带区面积计算得出的特征的值，所述特征包括中间区面积、低C条带区面积、28S峰面积和18S峰面积中的至少三个；和基于以下确定RNA断裂试验分数：1)中间区面积与28S峰面积和18S峰面积之和的比率；2)低C条带区面积与28S峰面积和18S峰面积之和的比率；或3)低C条带区面积和中间区面积之和与28S峰面积和18S峰面积之和的比率；其中所述方法不用于疾病诊断。