[发明专利]用于评估RNA断裂的试验、方法和设备

权利要求书

1.一种用于进行细胞RNA的RNA断裂试验的方法，其中所述方法包括：

获得与包含细胞RNA的特有生物样品相对应的至少一个电泳图谱数据集；

鉴定从用于所述特有生物样品的常用分析平台上的样品获得的所述至少一个电泳图谱数据集的标准样品；

确定来自所述标准样品的18S峰和28S峰的标准保留时间；

从所述至少一个电泳图谱数据集中确定特征的值，所述确定如下进行：利用两个识别范围和所述标准保留时间以容纳18S峰和28S峰的可能偏移，检测所述18S峰和28S峰，在限定所述18S峰和28S峰之后测定中间区和低C条带区，其中所述中间区在所测定的18S峰和28S峰之间，所述低C条带区是在所述18S峰下方且邻近所述18S峰的低条带区的上部分，并至少部分基于经定位的18S峰和28S峰以及所述中间区面积和低C条带区面积计算得出的特征的值，所述特征包括中间区面积、低C条带区面积、28S峰面积和18S峰面积中的至少三个；和

基于以下确定RNA断裂试验分数：1)中间区面积与28S峰面积和18S峰面积之和的比率；2)低C条带区面积与28S峰面积和18S峰面积之和的比率；或3)低C条带区面积和中间区面积之和与28S峰面积和18S峰面积之和的比率；

其中所述方法不用于疾病诊断。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法包括：

将所述特有生物样品鉴定为供试样品；

获得与所述标准样品相对应的电泳图谱数据集，所述标准样品是另一个特有生物样品或含有完整RNA或近似完整RNA的阳性对照样品；

将所述供试样品的所述电泳图谱数据集置于调整组，并将所述标准样品的所述电泳图谱数据集置于标准组；

鉴定代表来自所述标准组的标准样品的正常特点；

确定所述调整组中所述电泳图谱数据集的18S峰和28S峰的位置，并基于所述正常特点调整所述18S峰和28S峰的位置；和

在所述调整之后仅从所述供试样品的电泳图谱数据集中确定所述特征的值，或者当所述标准样品是另一个需要分析的特有生物样品时，还从所述标准组的电泳图谱数据集中确定所述特征的值。

3.根据权利要求1所述的方法，其中所述方法包括：

获得与包含细胞RNA的特有生物样品相对应的多个电泳图谱数据集；

将所述多个电泳图谱数据集分离成调整组和标准组；

从所述标准组中的所述多个电泳图谱数据集中鉴定代表标准样品的正常特点；

确定所述调整组中的电泳图谱数据集的18S峰和28S峰的位置，并且基于所述正常特点调整所述18S峰和28S峰的位置；和

从调整过的电泳图谱数据集和所述标准组的电泳图谱数据集中确定特征的值。

4.根据权利要求1、2或3所述的方法，其中所述方法包括限定默认范围作为所述的两个识别范围，以搜索18S峰和28S峰，如果标记物区不在其预期的位置，那么调整所述默认范围。

5.根据权利要求4所述的方法，其中所述默认范围对于所述18S峰而言包括39.5秒至44.95秒，对于所述28S峰而言包括45.05秒至53.5秒。

6.根据权利要求4所述的方法，其中所述方法包括当需要时，根据应用于至少一个参数值的一个或多个规则，重新限定所述18S峰和28S峰中的至少一个，所述至少一个参数值包括峰面积、峰宽和峰位置中的至少一个。

7.根据权利要求6所述的方法，其中所述一个或多个规则包括以下中的至少一个：基于峰面积确定所述18S峰和28S峰中的至少一个是否具有不止一个最大值；根据所述28S峰和18S峰面积的相互比较，确定所述18S峰和28S峰所处的边界是否需要进行调整；调整所述18S峰和28S峰的宽度使其在一定的宽度范围内；以及如果所述18S峰和28S峰之间的距离大于距离阈值，则要调整所述18S峰和28S峰中的至少一个的位置。