[发明专利]使用核酸探针和珠粒亚组检测呼吸道病原体的组合物和方法

摘要

本公开内容教导了检测和鉴定多种呼吸道病原体的多重核酸扩增测定。

主权项

1.一种对样品筛查多种呼吸道病原体以检测特定病原体的方法，其中所述样品是工业样品，或者是冰、岩石、热液喷口和空气；或者是来自卫生保健环境、工业环境或实验室环境的样品，所述方法包括：(a)从所述样品分离核酸，所述核酸推定包含来自一种或多种呼吸道病原体的核酸；(b)对所述核酸进行固相扩增，其中所述扩增采用包含SEQ ID NO：1的正向引物和SEQ ID NO：17的对应反向引物的含水引物对，以及固定在珠粒盘中的珠粒上的SEQ ID NO：37所示的相应寡核苷酸探针；其中所述含水引物对指导来自呼吸道病原体的核酸的区域的扩增，并且其中所述含水引物对的至少一个成员包含在扩增后被掺入所得扩增子内的第一光学可检测标记；其中通过与固定至珠粒盘中的珠粒上、与扩增子的区域互补的所述寡核苷酸探针杂交来捕获所述扩增子；所述珠粒盘具有珠粒亚组，每一个亚组在珠粒尺寸和任选地第二光学可检测标记的强度上是均质的，从而基于尺寸和/或第二光学可检测标记的强度产生异质珠粒盘，并且其中亚组的数目对应于待筛查的呼吸道病原体的数目；(c)基于所述第一光学可检测标记的强度确定扩增子已结合于哪个珠粒，并且当扩增子结合于多个亚组的珠粒时，基于珠粒尺寸和任选地基于第二光学可检测标记的强度区分所述多个亚组的珠粒；其中扩增子对特定亚组的珠粒的结合指示样品中存在特定呼吸道病原体。