[发明专利]全基因组mRNA3′末端基因文库的构建方法有效

专利信息
申请号: 201110062417.7 申请日: 2011-03-16
公开(公告)号: CN102181527A 公开(公告)日: 2011-09-14
发明(设计)人: 徐安龙;付永贵;孙雨;李宇新;万谅;饶兴蔷 申请(专利权)人: 中山大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C40B50/06;C40B40/06
代理公司: 广州三环专利代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫
地址: 510275 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明涉及一种适用于高通量测序的全基因组mRNA3′末端文库的制备方法,通过模板转换合成cDNA一链及PCR引入突变,获取全基因组mRNA3′非翻译区DNA序列。本发明全基因组mRNA3′末端文库的制备方法制得的文库数据产出量大,样品准备步骤简便、经济,便于后期生物信息学分析,易于大规模应用。
搜索关键词: 基因组 mrna3 末端 基因 文库 构建 方法
【主权项】:
一种全基因组mRNA 3’末端基因文库的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:(a) 将基因组的核酸采用DNase消化;(b) 将消化后的总RNA高温94‑95℃加热,随机片段化至约200‑500bp的片段; (c) 利用模板转换技术进行反转录反应合成cDNA第一链,所述的cDNA第一链的两端连有高通量测序引物; (d) 利用在cDNA第一链两端接上的测序引物通过高保真DNA聚合酶进行PCR扩增;(e) PCR产物用10%聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,选择200‑300bp或300‑500bp的大小进行回收,得到目的片段。
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