[发明专利]组合化学集中库设计与优化方法无效
| 申请号： | 200410053102.6 | 申请日： | 2004-07-23 |
| 公开（公告）号： | CN1725222A | 公开（公告）日： | 2006-01-25 |
| 发明（设计）人： | 罗小民;蒋华良;陈刚;沈建华;郑苏欣;张健;柳红;沈旭;陈凯先 | 申请（专利权）人： | 中国科学院上海药物研究所 |
| 主分类号： | G06F17/50 | 分类号： | G06F17/50 |
| 代理公司： | 上海开祺知识产权代理有限公司 | 代理人： | 李兰英 |
| 地址： | 201203上海市浦*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 一种组合化学集中库设计与优化方法，是对一种虚拟组合化学集中库软件包的设计、建立与评价优化的方法。包括第一步以靶标为基础设计虚拟组合初步筛选库；第二步建立虚拟组合初步筛选库并对分子构象进行优化；第三步对虚拟组合初步筛选库进行评价及其优化。本发明采用遗传算法与组合化学方法相结合，可以用于基于大分子靶标三维结构的全新药物的设计和研究。对靶标具有比较高的亲和性，多样性和类药性。具有速度快、费用低、不耗费任何实验器材，完全通过计算模拟的方法来完成组合化学集中库的设计和优化。 | ||
| 搜索关键词： | 组合 化学 集中 设计 优化 方法 | ||
【主权项】：
1、一种组合化学集中库设计与优化方法，是对一种虚拟组合化学集中库软件包的设计、建立与评价优化的方法，其特征在于方法步骤包括：<1>首先设计以靶标为基础的虚拟组合初步选库，包括：确定组合合成针对的靶标蛋白；设计组合合成路线，挑选组合构建单元；再选定组合合成中的各基本构建单元的单元构件集合；<2>第二步根据上述的设计，建立虚拟组合初步筛选库，包括：依据组合化学反应，从指定构造单元中读取指定的单元，构件相应的虚拟组合初步筛选库；然后对获得的虚拟组合初步筛选库中的分子构象进行优化；<3>第三步对上述建立的虚拟组合初步筛选库进行评价及其优化，包括：首先建立模块结构的评价体系；然后采用遗传算法对虚拟组合初步筛选库的化合物进行优化。
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