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[发明专利]构建鉴定感染性疾病和非感染性疾病的机器学习模型的方法-CN202210566863.X有效
发明人：祝中一;麻锦敏;陈唯军 -专利权人：深圳华大基因股份有限公司;深圳华大医学检验实验室
申请日： 2022-05-23 - 公布日： 2023-08-04 - 主分类号： C12Q1/6883 文献下载
摘要：本发明提出了构建鉴定感染性疾病和非感染性疾病的机器学习模型的方法，所述方法包括：分别测定已知患有感染性疾病受试者和已知患有非感染性疾病受试者的生物样本中宿主基因表达量值和/或微生物相对丰度值；分别将所述宿主基因表达量值和/或微生物相对丰度值输入训练器，以感染性疾病和非感染性疾病作为标记，进行训练，以便获得鉴定感染性疾病和非感染性疾病的机器学习模型。利用该机器学习模型可以准确鉴定感染性疾病和非感染性疾病，具有重要的科学研究和临床诊断价值。
构建鉴定感染性疾病机器学习模型方法

[发明专利]从样本中鉴定微生物物种的方法和装置-CN201710447898.0有效
发明人：姬敬开;麻锦敏 -专利权人：深圳华大生命科学研究院
申请日： 2017-06-14 - 公布日： 2022-04-19 - 主分类号： C12Q1/70 文献下载
摘要：本发明提出从样本中鉴定微生物物种的方法和装置。该方法包括：获得DNA和RNA测序结果；将DNA测序结果进行比对，以便获得第一候选微生物集合和特异性DNA测序读段集合；将RNA测序结果进行比对，以便获得第二候选微生物集合和特异性RNA测序读段集合；选取第一候选微生物集合和第二候选微生物集合的交集的至少一部分作为第三候选微生物集合；分别从特异性DNA和RNA测序读段集合中选取相同数目的特异性DNA和RNA测序读段，分别获得过滤DNA和RNA测序读段集合；以及对第三候选微生物集合进行过滤处理，以便获得第四候选微生物集合，构成样本中的微生物物种。由此，能够准确地鉴定到种水平的微生物，避免背景微生物干扰，同时可找出活跃表达的致病性微生物，且操作简便。
样本鉴定微生物物种方法装置

[发明专利]构建用于手足口样本归类的模型的方法及其应用-CN202010313182.3在审
发明人： 麻锦敏;李琼芳;陈唯军 -专利权人：深圳华大因源医药科技有限公司
申请日： 2020-04-20 - 公布日： 2020-08-18 - 主分类号： G16B20/20 文献下载
摘要：本发明提出了一种用于区分手足口样本的方法。该方法包括：确定待测样本的第一标志基因组合中每个基因的表达量；将所述第一标志基因组合的表达量结果输入至第一分类模型，以便将所述手足口样本在轻症状组和重症状组之间进行区分。
构建用于手足样本归类模型方法及其应用

[发明专利]一种用来评估H7N9感染患者预后的标记物及其制备方法-CN201711261041.6有效
发明人：刘映霞;王珲;李力强;麻锦敏;王新发 -专利权人：深圳市第三人民医院
申请日： 2017-12-04 - 公布日： 2020-07-31 - 主分类号： G01N33/569 文献下载
摘要：本发明涉及一种用来评估H7N9感染患者预后的标记物，包括BLC、IL‑8、HGF、MIF、IGFBP‑1、GDNF、IGFBP2、Leptin、ENA78、IP10、TIMP2和THPO中的至少一种。其制备方法，包括如下步骤：1)制备H7N9感染患者的血浆样本；2)对血浆样本进行血浆细胞因子和趋化因子的检测，得到细胞因子和趋化因子数据；3)比较健康对照组、轻症组、重症组和死亡组的血浆样本中的细胞因子和趋化因子，通过受试者工作特征曲线分析得出标记物。本发明的用于预测的单因子是之前那文献未有报道的，属于新发现的标记物，并能够准确的预测H7N9患者的预后情况；本发明的用于预测的多因子模型，其中预测死亡模型的准确性达到100％。
一种用来评估 h7n9 感染患者预后标记及其制备方法

[发明专利]基于外泌体核酸进行微生物检测的方法及其应用-CN201880017694.6在审
发明人：卢森;高雅;姬敬开;麻锦敏;赵佳;黄国栋;陈芳;蒋慧 -专利权人：深圳华大生命科学研究院
申请日： 2018-04-16 - 公布日： 2019-11-15 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明提供了基于外泌体核酸进行微生物检测的方法及其应用。所述方法包括：(a)从待测样品中分离获得外泌体核酸，所述待测样品来自于第一物种；(b)对所述外泌体核酸进行测序，获得测序结果；(c)从所述测序结果中排除对应于所述第一物种的核酸序列，从而获得经去除处理的序列数据；和(d)将所述经去除处理的序列数据与微生物数据库的核酸序列进行比对，获得所述样品中的微生物检测结果。
核酸测序微生物检测待测样品核酸序列序列数据去除物种比对微生物数据库应用

[发明专利]测序获取寄生虫核酸信息及对寄生虫分类的方法和系统-CN201810205702.1在审
发明人：姬敬开;麻锦敏 -专利权人：深圳华大生命科学研究院
申请日： 2018-03-13 - 公布日： 2019-09-24 - 主分类号： C12Q1/6869 文献下载
摘要：本发明涉及高通量测序领域，具体涉及一种高通量测序获取宿主上寄生虫核酸信息及对寄生虫分类的方法和系统。获取寄生虫核酸信息的方法包括：基于高通量测序，获取宿主血液中游离DNA的序列数据；参照宿主核酸序列，将所述宿主血液中游离DNA的序列数据中含有的宿主核酸数据过滤掉；将所述宿主血液中游离DNA的序列数据中含有的重复序列数据过滤掉；获得寄生虫核酸数据，从而获得宿主上寄生虫的核酸信息。在此基础上进一步提供了获取寄生虫核酸信息的系统，以及鉴定宿主上寄生虫的种类的方法和系统。本方法以及所提供的系统不局限于先验知识，提高了检测方法的通用性，而且灵敏度高，且快速。
寄生虫宿主核酸高通量测序序列数据游离DNA 数据过滤宿主核酸血液先验知识重复序列灵敏度分类测序局限检测

[发明专利]病历数据处理方法、装置以及系统-CN201510724624.2有效
发明人：徐翼;麻锦敏 -专利权人：徐翼;麻锦敏
申请日： 2015-10-29 - 公布日： 2018-09-28 - 主分类号： G16H50/70 文献下载
摘要：本发明涉及临床医学技术领域，具体而言，涉及一种病历数据处理方法、装置以及系统。该方法包括：获取当前患者的病历数据；运用预先建立的病症程度模型对所述病历数据进行运算，其中，所述病症程度模型是预先根据已经确定了疾病程度的多个患者的病历数据建立的；根据所述运算的结果确定所述当前患者的疾病程度；显示与所述当前患者的所述疾病程度。该方法通过病症程度模型，对当前患者的病历数据进行运算，确定患者的疾病程度，医生只需要在临床医疗中，直接获取患者的病历数据，并在看到所显示的当前患者的疾病程度之后，再结合实际的情况判断患者的疾病程度，即判断手足口病的发展阶段，减少临床中对手足口病病情的延误。
病历数据处理方法装置以及系统

[发明专利]鉴定病毒的方法和装置-CN201510125249.X有效
发明人： 麻锦敏;王珲 -专利权人：深圳华大基因股份有限公司
申请日： 2015-03-20 - 公布日： 2018-03-30 - 主分类号： G06F19/22 文献下载
摘要：本发明公开了一种鉴定病毒的方法，该方法包括获取待测样本的RNA测序数据；对测序数据的第一部分进行组装，获得组装序列；将测序数据的第一部分与组装序列进行比对，获得比对结果；基于比对结果，确定组装序列上的突变位点，以及确定各组装序列的(a)‑(c)中的至少之一(a)平均熵值和中位数熵值至少之一，以及突变位点比例，(b)平均突变率和中位数突变率至少之一，以及突变位点比例，(c)突变位点比例；将组装序列的(a)‑(c)至少之一和与其对应的界限比较，判定落入界限的组装序列来自病毒。本发明还公开一种鉴定病毒的装置。利用本发明的方法和/或装置鉴定病毒，能够不依赖同源序列比对来准确预测未知序列是否为病毒序列。
鉴定病毒方法装置

[发明专利]用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的标志物-CN201510542863.6有效
发明人：刘映霞;王珲;麻锦敏 -专利权人：深圳市第三人民医院
申请日： 2015-08-28 - 公布日： 2015-12-23 - 主分类号： C12Q1/68 文献下载
摘要：本发明提供用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的两套标志物，每套标志物中的九个基因组合物的用途，以及用来评估艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的产品；本发明还提供了一种引物组合物及其用途，和两种筛选艾滋病人发生免疫重建炎性综合症的生物样品的系统。经实验证明，本发明所列的每套标志物中的特定基因在HIV合并TB感染的病人血液中的PBMC里的表达量的线性组合能显著区分发生和不发生免疫重建炎性综合症的人群，以及判断引起免疫重建炎性综合症的风险大小，因此这些基因的线性组合可作为评价艾滋病人是否发生免疫重建炎性综合症的预警因子，使临床治疗更加个性化。
用来评估艾滋病人发生免疫重建综合症标志

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