本发明公开了一种与棉花纤维长度相关的分子标记及其应用,属于棉花遗传育种技术领域。所述分子标记位于棉花基因组第16号染色体,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,包括突变位点SNP 1;所述SNP 1为chr16_41836768AG。本发明发现该位点与棉花纤维长度相关,并通过试验验证了,AA基因型个体纤维长度显著高于GG型个体(p0.05),为优势基因型。本发明提供的分子标记可以准确的鉴定棉花纤维长度性状,有利于培育纤维品质较好的棉花个体,剔除纤维品质较差的个体,提高棉花的纤维品质,从而为优质棉花的选育提供科学依据。
本发明公开了鉴定棉花纤维比强度和马克隆值的SNP分子标记及应用,所述SNP分子标记有两个,分别为chr23_16630630和chr23_16596338;chr23_16630630位于SEQ ID No.1所示的核苷酸序列的第201位,且该处碱基为T或C;chr23_16596338位于SEQ ID No.2所示的核苷酸序列的第201位,且该处碱基为A或G。本发明在QTL定位基础上发现两个SNP标记,这两个标记在鉴定纤维比强度和马克隆值方面效果显著,可用于棉花纤维比强度和马克隆值分子标记辅助育种。
本发明属于农作物培育技术领域,具体涉及一种用于陆地棉第一果枝节位基因分型鉴定的KASP分子标记引物组及其应用。KASP分子标记引物组中,正向引物包含如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示序列;反向引物包含与SEQ ID NO:3所示序列。该KASP分子标记引物组可以对陆地棉第一果枝节位进行准确基因分型,进而可以准确鉴定第一果枝节位,提早预测材料的早熟性和株型,为加快适机采棉花新品种的选育效率提供更多标记资源。
本发明公开了一个鉴定陆地棉衣分的SNP分子标记,所述分子标记位于SEQ ID No.1所示核苷酸序列的第501位置处,该处碱基为T或C。检测待鉴定陆地棉基因组DNA中SNP位点的基因型,如果基因型为TT,则该陆地棉具有高衣分性状;如果基因型为CC,则该陆地棉具有低衣分性状。本发明的SNP分子标记可用于新品种选育,有助于打破遗传连锁、提高育种效率。