本发明公开了一种Cas蛋白截短体、构建其的方法及其应用。所述Cas13蛋白截短体由以下(1)‑(3)中任一种组成:(1)相对如SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列存在选自第623‑772位、第773‑922位、第923‑1072位、第623‑1072位、第923‑972位、第973‑1022位、第1023‑1072位、第973‑1072位、第623‑672位、第673‑722位、第723‑772位、第773‑822位、第823‑872位、第873‑922位、第1127‑1272位、第994‑1107位、第726‑827位、第263‑315位、第82‑132位、第187‑243位、第610‑661位、第593‑658位和第810‑905位的任一种缺失的截短体序列;(2)同源或异源蛋白结构域,以及(1)中所述截短体序列;(3)同源或异源蛋白结构域,(1)中所述截短体序列,以及用于连接所述蛋白结构域与所述截短体序列的连接序列。本发明的Cas蛋白截短体在保持编辑活性的同时大大减小了蛋白尺寸,便于AAV递送,具有广泛的应用前景。