本发明公开了一种用于特异性定量普通高温放线菌的分子标记和试剂盒及其应用,属于生物工程领域。本发明提供了SEQ ID NO:4所示的分子标记作为鉴定或特异性定量普通高温放线菌(Thermoactinomyces vulgaris)的标志物的应用。本发明通过实验发现可定性鉴定或特异性定量普通高温放线菌的分子标记,该分子标记作为标志物可以准确识别普通高温放线菌,并可特异性定量普通高温放线菌。同时,本发明还提供了以此分子标记和扩增该标记的引物制备的试剂盒和精准检测样品中普通高温放线菌的方法;该试剂盒或特异性定量普通高温放线菌的方法,检测特异性好,有效性高,可以快速准确定性或定量普通高温放线菌,有助于在酿造生产过程或酿造产品中对该细菌进行定性或特异性定量监测。