本发明属于基因工程技术领域,提供了芝麻抗旱、耐湿与耐盐基因SiNAC56及其编码的蛋白与应用;所述芝麻抗旱、耐湿与耐盐基因SiNAC56为如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列;或者为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列经过添加、取代、插入或缺失一个或多个核苷酸而产生的具有抗旱性的核苷酸序列;本发明将SiNAC56基因构建到表达载体,通过农杆菌介导的转化方法,将SiNAC56基因转入拟南芥,获得转基因拟南芥;通过将抗旱、耐湿及耐盐相关芝麻基因SiNAC56在拟南芥中的过量表达,发现此基因可显著提高植物的抗旱、耐湿和耐盐能力,因此本发明在提高植物抗旱、耐湿及耐盐等性能上有很好的应用前景。