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[发明专利]区分复杂生物样品中的甲基化水平-CN202310097701.0在审
发明人： J.唐;L.刘;M-J.R.沈;R.张 -专利权人： 伊路敏纳公司
申请日： 2016-12-15 - 公布日： 2023-03-31 - 主分类号： G16B40/00 文献下载
摘要：本发明涉及区分复杂生物样品中的甲基化水平。本文提供一种用于区分来自第一细胞类型的DNA的异常甲基化水平的方法，其包括以下步骤：(a)提供测试数据集；(b)提供来自一个或多个参考个体生物体的参考基因组DNA中的所述多个位点的甲基化状态，(c)针对每个所述位点确定所述测试基因组DNA与所述参考基因组DNA之间的甲基化差异，从而提供每个位点的归一化甲基化差异；以及(d)通过每个所述位点处的所述覆盖对每个位点的所述归一化甲基化差异进行加权，从而确定合计的覆盖加权的归一化甲基化差异分数。本文还提供用于使用基因组DNA甲基化水平来从正常细胞区分癌细胞并且根据其起源组织分类不同癌症类型的灵敏方法。
区分复杂生物样品中的甲基化水平

[发明专利]区分复杂生物样品中的甲基化水平-CN201680082163.6有效
发明人： J.唐;L.刘;M-J.R.沈;R.张 -专利权人： 伊路敏纳公司
申请日： 2016-12-15 - 公布日： 2023-01-31 - 主分类号： C12Q1/6881 文献下载
摘要：本文提供一种用于区分来自第一细胞类型的DNA的异常甲基化水平的方法，其包括以下步骤：(a)提供测试数据集，其包括(i)来自至少一个测试生物体的测试基因组DNA的多个位点的甲基化状态，和(ii)用于检测所述甲基化状态的每个所述位点处的覆盖；(b)提供来自一个或多个参考个体生物体的参考基因组DNA中的所述多个位点的甲基化状态，(c)针对每个所述位点确定所述测试基因组DNA与所述参考基因组DNA之间的甲基化差异，从而提供每个位点的归一化甲基化差异；以及(d)通过每个所述位点处的所述覆盖对每个位点的所述归一化甲基化差异进行加权，从而确定合计的覆盖加权的归一化甲基化差异分数。本文还提供用于使用基因组DNA甲基化水平来从正常细胞区分癌细胞并且根据其起源组织分类不同癌症类型的灵敏方法。
区分复杂生物样品中的甲基化水平

[发明专利]高通量单细胞文库及其制备和使用方法-CN202080026206.5在审
发明人： J·沈杜尔;D·库萨诺维奇;R·达扎;F·斯蒂默斯 -专利权人： 伊路敏纳公司;华盛顿州大学
申请日： 2020-12-18 - 公布日： 2022-02-01 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本文提供了用于制备包括来自多个单细胞的核酸的测序文库的方法。在一个实施方案中，该测序文库包含代表来自该多个单细胞的染色质可及性的核酸。在一个实施方案中，该核酸包含三个索引序列。在另一个实施方案中，本公开提供了用于表征分离的细胞和细胞核中罕见事件的方法。
通量单细胞文库及其制备使用方法

[发明专利]高通量单细胞核和单细胞文库及其制备和使用方法-CN202080005474.9在审
发明人： S·斯里瓦特桑;J·麦法莱恩-费盖罗亚;V·拉马尼;J·曹;G·布思;J·申杜尔;C·特拉普内尔;F·J·斯蒂默斯 -专利权人： 伊路敏纳公司;华盛顿州大学
申请日： 2020-03-02 - 公布日： 2021-08-24 - 主分类号： C12N15/10 文献下载
摘要：本文提供了用于制备包括来自多个单细胞的核酸的测序文库的方法。在一个实施方案中，该方法包括细胞核或细胞散列，该细胞核或细胞散列允许增加的样本通量以及增加的高冲突率下的双重体检测。在一个实施方案中，该方法包括归一化散列，该归一化散列有助于估计和去除细胞间变异的技术噪声并提高灵敏度和特异性。
通量细胞核单细胞文库及其制备使用方法

[发明专利]具有改进的气体管理的电渗泵-CN200980147374.3有效
发明人：乔纳森·波斯纳;卡米尔·萨洛姆;迈克尔·莱伯;马克·里德;戴尔·比尔曼;马修·哈格;布赖恩·克兰;戴维·海纳;罗伯特·卡因 -专利权人： 伊路敏纳公司;阿利桑那州立大学校董会
申请日： 2009-11-25 - 公布日： 2012-01-04 - 主分类号： F04B19/00 文献下载
摘要：提供电渗（EO）泵，其包括具有泵腔的壳体、多孔芯介质以及电极。多孔芯介质定位在泵腔内，以形成外贮存器，该外贮存器至少部分地绕多孔芯介质的外表面延伸。多孔芯介质具有在其中提供的开口内腔。内腔代表内贮存器。电极定位在内腔中并且定位成靠近外表面。电极引发流体流通过内和外贮存器之间的多孔芯介质，其中当电极引发流体流时产生气体。壳体具有流体入口，以将流体传输至内贮存器和外贮存器中的一个。壳体具有流体出口，以从所述内贮存器和外贮存器中的另一个排出流体。壳体具有气体移除装置，以从泵腔移除气体。
具有改进气体管理电渗泵

[发明专利]读取编码微珠的方法和设备-CN200580046616.1无效
发明人： J·A·穆恩 -专利权人： 伊路敏纳公司
申请日： 2005-11-16 - 公布日： 2008-01-30 - 主分类号： G06K7/10 文献下载
摘要：提供一种用于读取其上具有代码的微珠的方法和设备，其中代码被投射在傅里叶平面上并且从傅里叶平面读取该代码。微珠的形体尺寸可以是1－1000微米(μm)或更小。通过使入射光散射离开微珠而将代码投射在傅里叶平面上。将从微珠散射的光引导通过具有用于将代码投射在傅里叶平面上的变换透镜的光学装置，并利用电荷耦合器件(CCD)或其他类似装置在傅里叶平面上读取代码。代码可以包括具有不同折射率或相位、包括折射率差的周期性材料层；具有不同相位或振幅的周期性空间调制；用于对傅里叶平面内的信息进行编码的周期性二元相位变化；用于对微珠上的信息进行编码的光子晶体，其中穿孔图案导致入射光和散射光之间的干涉在远场中形成空间和光谱特性曲线，这些空间和光谱特性曲线对于穿孔图案是唯一的；或者可以利用单个光敏内区、一系列纵向孔、不同的荧光区、或者预制件中的材料的同心环而在微珠中形成代码。
读取编码方法设备