本发明公开了GhGLU18A蛋白、编码基因及其在调控植物纤维强度、马克隆值中的应用,属于分子生物学技术领域。本发明提供一种蛋白,所述蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。通过对一个β‑1,3‑葡聚糖酶基因GLU18A构建过表达载体转化拟南芥和棉花,发现转基因拟南芥根细胞壁厚度较对照显著减小及过表达转基因棉花纤维强度和马克隆值较对照显著降低。说明该蛋白及其编码基因在调控棉花的纤维强度和马克隆值中具有重要的应用价值,将在农业领域具有广阔的应用空间和市场前景。
本发明公开了同时与陆地棉纤维长度、伸长率、马克隆值、强度和铃重性状关联的SNP分子标记及应用,所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.91任一所示核苷酸序列。本发明提供的同时与陆地棉纤维长度、伸长率、马克隆值、强度和铃重关联的SNP分子标记可以用于棉花上述性状的早期预测和筛选。其直接以DNA的形式表现,在棉花的各个组织、各个发育阶段均可检测到,不受季节、环境限制、不存在表达与否等问题;表现为中性,不影响目标性状的表达;SNP适于快速、规模化筛查。基因组筛选中SNPs往往只需+/‑的分析,而不用分析片段的长度,利于发展自动化技术筛选或检测SNPs。
本发明公开了与陆地棉棉铃重关联的SNP分子标记及其应用,属于分子生物学、生物信息学领域。所述SNP分子标记为如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.3所示核苷酸序列中至少一个。本发明提供的与陆地棉棉铃重关联的SNP分子标记可以用于棉花棉铃重性状的早期预测和筛选。其直接以DNA的形式表现,在棉花的各个组织、各个发育阶段均可检测到,不受季节、环境限制、不存在表达与否等问题;表现为中性,不影响目标性状的表达;SNP适于快速、规模化筛查。基因组筛选中SNPs往往只需+/‑的分析,而不用分析片段的长度,利于发展自动化技术筛选或检测SNPs。
本发明提供了一种棉花GhGT‑3b_A04基因、蛋白质、表达载体、转基因植物获取方法和应用,属于分子生物学和生物技术领域,所述棉花GhGT‑3b_A04基因的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。GhGT‑3b_A04基因能增强拟南芥黄萎病抗性,且获得的转基因植株均能正常开花结果,转化基因能稳定遗传至下一代,故该基因可以进一步运用于黄萎病抗性改良,培育出抗黄萎病新品种,为植物黄萎病抗性改良提供新途径;本发明为植物根系和表皮毛发育调控提供理论依据;本发明为黄萎病抗性改良、植物根系和表皮毛研究提供新材料。
本发明公开了与陆地棉亚麻酸关联的SNP分子标记及其应用,所述SNP分子标记为如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.28所示核苷酸序列中至少一个,所述SNP分子位点于序列第51bp处发生突变。本发明提供的与陆地棉亚麻酸关联的SNP分子标记可以用于棉花亚麻酸性状的早期预测和筛选。其直接以DNA的形式表现,在棉花的各个组织、各个发育阶段均可检测到,不受季节、环境限制、不存在表达与否等问题;表现为中性,不影响目标性状的表达;SNP适于快速、规模化筛查。基因组筛选中SNPs往往只需+/‑的分析,而不用分析片段的长度,利于发展自动化技术筛选或检测SNPs。
本发明公开了与棉花纤维强度品质性状关联的SNP分子标记及应用,属于分子生物学,生物信息学领域。所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.126所示核苷酸序列中至少一个。本发明提供所述与陆地棉纤维强度关联的SNP分子标记,在棉花的各个组织和发育阶段均可检测,不受环境和季节限制,不存在表达与否影响,不用分析片段的长度,只需+/‑的分析,适于快速、规模化、自动化筛查,单独或组合使用可辅助鉴定出高、低强度纤维种质材料,能大大节省育种改良的工作。
本发明公开了与棉花纤维伸长率品质性状关联的SNP分子标记及应用,属于分子生物学,生物信息学领域。所述SNP分子标记为SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.39所示核苷酸序列中至少一个,SNP分子位点于序列第51bp处发生突变。本发明提供的SNP分子标记,是使用迄今为止,棉花中最大的群体检测出来的SNP。相对其他群体,有更准确和新的信号位点。可以用于棉花纤维伸长率早期更为准确全面的预测和筛选。其以DNA形式体现,不受取样部位、环境等因素影响,可以直接以是否有该标记分析。
本发明公开了陆地棉D12号染色体与棕榈油酸关联的SNP分子标记及其应用,所述SNP分子标记为如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.27所示核苷酸序列中至少一个。本发明通过对1279份棉花材料进行了2年、1个地点、2个自然环境的种植,并检测分析了这些品种的棕榈油酸。通过IlluminaHiseq测序平台对这1279份棉花品种进行基因组重测序,获得高质量的cleandata,亲本平均测序深度35X,子代平均测序深度4X以上。通过GWAS分析累计2个计算值,获得至少在一个及以上环境中稳定出现的与陆地棉棕榈油酸关联的SNP分子标记27个。本发明不仅可用于棉花棕榈油酸的早期预测和筛选,还可用于高棕榈油酸和低棕榈油酸棉花品种的选育。
本发明公开了一种棉花纤维长度相关microRNA及编码该棉花纤维长度相关microRNA的前体DNA,所述棉花纤维长度相关microRNA序列为如SEQ ID NO:1所示的核酸序列或由SEQ ID NO:1所示序列经过一个或几个核酸的取代和/或缺失和/或添加且与棉花纤维长度相关的衍生的核酸序列。本发明提供的棉花纤维长度相关microRNA及其前体DNA,将前体DNA导入棉花,可以显著提高棉花纤维长度。本发明对于培育棉花新品种具有重要的意义,适合于推广应用。