本发明属于基因检测技术领域，公开了用于检测西瓜LIM基因家族的引物对、试剂盒及方法和应用，该引物对包括12对引物对，所述引物对的序列如SEQ ID NO:1～SEQ ID NO:24所示。本发明提供的12对引物对，可快速、特异、准确检测出西瓜LIM基因家族在花药不同发育阶段下的表达特性，为利用花药培育西瓜单倍体打下基础。
本发明公开了一种同时鉴定棉花细胞质雄性不育恢复基因Rf1、Rf2的InDel标记。该InDel标记，不仅与哈克尼西棉细胞质雄性不育恢复基因Rf1连锁而且与三裂棉细胞质雄性不育恢复基因Rf2连锁，该核苷酸序列的插入/缺失长度多态性呈现在琼脂糖凝胶电泳图上可鉴定棉花单株是否含有恢复基因且能判定含有恢复基因的类型，该InDel标记由SEQ ID NO.1‑2所示的引物扩增得到。该InDel标记对不同恢复基因(Rf1/Rf2)的棉花新恢复系材料的选育和保证三系杂交种种子纯度方面具有重要作用。本InDel标记可以鉴定棉花的两套细胞质雄性不育的不同的恢复基因类型，其适用范围更广，实用性更好。
本发明提供了一种三裂棉细胞质雄性不育恢复基因的分子鉴定方法，其InDel分子标记为36bp的核苷酸序列缺失，InDel分子标记引物如SEQ ID NO.2‑3所示。采用InDel分子标记引物进行PCR扩增，如果片段长度为275bp的条带，则为不含三裂棉细胞质雄性不育恢复基因的材料；如果片段长度为239bp的条带，则为三裂棉细胞质雄性不育恢复基因位点纯合的恢复系材料；如果PCR产物电泳结果同时出现两条，片段长度为275bp和239bp的两条带，则为恢复基因杂合位点的材料。本发明可以加快恢复系选育和改良进程，缩短选育周期，同时保证恢复系种子和三系杂交种子的纯度，显著减少田间材料性状调查的工作量。
