本发明属于分子生物技术领域，公开了一种与海雀稗耐黑痣病性状相关的SNP分子标记及其应用，所述SNP分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，其中，SEQ ID NO.1所示序列的第401bp处存在G/T突变。本发明通过172份海雀稗种质的重测序数据，结合12个月海雀稗田间黑痣病发病情况作为质量性状进行全基因组关联分析，定位筛选出与耐黑痣病相关的分子标记，该分子标记对海雀稗耐黑痣病的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，快速预测或鉴定其黑痣病的抗性，可有效筛选得到强耐黑痣病的海雀稗品种，加速海雀稗育种进程。
本发明公开了一种海雀稗根系富集镉含量性状的SNP分子标记及其应用，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中SNP位点为：在SEQ ID NO.1所示序列的第401bp处存在G/A突变。本发明通过对86份海雀稗种质进行重测序，结合镉胁迫处理后海雀稗根系富集镉含量的表型数据进行全基因组关联分析，定位筛选出与其根系富集镉含量多少性状相关的分子标记，研究发现其中位于第02号染色体的第30702908bp位置处的SNP分子标记Pv.chr02:p30702908对海雀稗根系富集镉含量性状的贡献率高，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，快速预测或鉴定其根系可富集镉含量的高低，有效筛选得到可高效富集镉的海雀稗品种，不仅加速了海雀稗育种进程，并且对土壤镉污染防治具有重要意义，适于大规模推广应用。
本发明公开了一种海雀稗耐镉性状的SNP分子标记及其应用，所述分子标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO.1所示，其中SNP位点为：在SEQ ID NO.1所示序列的第401bp处存在A/G突变。本发明通过172份海雀稗种质的重测序数据，结合镉胁迫后海雀稗相关性状的表型数据进行全基因组关联分析，定位筛选出与耐镉性状相关的分子标记，研究发现其中位于第04号染色体的第41351449bp位置处的SNP分子标记Pv.chr04:p41351449对海雀稗耐镉性状的贡献率高，对海雀稗耐镉性状的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，从而有效筛选得到强耐镉性状的海雀稗品种，加速海雀稗育种进程，适于大规模推广应用。
