本发明公开了转录因子ZmbZIPa6及其编码基因与应用。本发明首先公开了一种蛋白质,所述蛋白质为氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示的蛋白质或SEQ ID NO.2所示的氨基酸序列的N端或/和C端连接蛋白标签得到的融合蛋白。本发明进一步提供了上述蛋白质的编码基因及其在调控植物耐旱性中的应用。本发明将ZmbZIPa6基因导入野生型拟南芥中,得到转ZmbZIPa6拟南芥与野生型拟南芥相比,其耐旱性及耐碱性明显提高,说明ZmbZIPa6是与植物耐旱和耐碱相关的基因;对于培育耐旱性及耐碱性的作物、林草等新品种具有重要的理论及实际意义,可用于农牧业和生态环境治理所需的抗性植物品种的培育与鉴定。