本发明公开了一种相对定量分析肉鸡谷胱甘肽S转移酶GSTA2的方法,先进行肉鸡谷胱甘肽S转移酶GSTA2的提取,再对肉鸡谷胱甘肽S转移酶GSTA2进行酶切获得特异性肽段,然后使用液质联用仪检测特异性肽段的子母离子对,获得特异性肽段的子离子信号强度总和,根据特异肽段的子离子信号强度总和获得GSTA2蛋白的信号强度,通过比较不同处理肉鸡样品中GSTA2蛋白的信号强度,从而实现对不同处理肉鸡样品中GSTA2蛋白的相对定量;肉鸡谷胱甘肽S转移酶GSTA2的特异性肽段为3条,其氨基酸序列分别为SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2和SEQ ID NO:3所示。本发明的方法相对于基于抗体Western Blot法特异性更强,并且免去了制备抗体的繁琐步骤,提高了鸡源GSTA2蛋白检测通量和效率。