本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪的饲料转化效率相关的SNP分子标记。该SNP分子标记登陆号为MARC0045707,通过整合实验室采集的16个批次的包含大白猪、长白猪、杜洛克猪和皮特兰猪这四个品种的4005头猪的SNP芯片数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,得到一种与猪的饲料转化效率相关的SNP分子标记,该SNP标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该序列的第51位的碱基处R是突变位点,由碱基A突变为碱基G,该突变位点导致所示序列的核苷酸产生多态性;当SEQ ID NO:1所述序列的第51位核苷酸为G时,判定猪的饲料转化效率较低。
本发明属于动物分子标记筛选技术领域,具体涉及MAN1C1基因片段作为猪骨密度性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0028695MAN1C1基因片段,即猪第6号染色体MAN1C1基因第一内含子上,通过基因芯片技术对该基因进行分型,筛选得到一种与母猪的骨密度性状相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该序列的第401位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变,当SEQ ID NO:1序列上的第401位核苷酸为C时,母猪的肢蹄具有更高的骨密度。公开了母猪肢蹄骨密度分子标记的筛选方法及其关联分析。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了新的分子标记资源。
本发明属于动物分子标记制备筛选技术领域,具体涉及一种与母猪肢蹄骨密度相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为MARC0002557的基因片段,通过基因芯片技术对该基因进行分型,筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变,且当SEQ ID NO:1上的第51位核苷酸为T时,则证明母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明还公开了与母猪肢蹄骨密度相关分子标记的制备方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪性成熟期性状相关SNP分子标记。通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所公开的58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,筛选得到一种与猪性成熟期相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第51位碱基处存在一个A/C的等位基因突变,当序列第51位核苷酸为C时,有利于猪拥有更长的性成熟期。
本发明属于动物分子标记筛选领域,具体涉及与与母猪肢蹄骨密度相关的FAM131C基因的SNP分子标记。通过基因分型技术并参阅Ensembl数据库,得到登录号为ASGA0099279基因上下游100bp序列的FAM131C基因片段,序列如SEQ ID NO:1所示。利用基因芯片技术对FAM131C基因进行分型,筛选到与母猪肢蹄骨密度相关的标记,其序列如SEQ ID NO:1所示,上述序列的第101位碱基处的R是C或T,导致核苷酸序列的多态性。可作为检测与猪骨密度相关的分子标记,当SEQ ID NO:1上的第101位核苷酸为C时,则母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明为猪骨密度的标记辅助选择提供了新的SNP标记。
本发明属于猪分子标记制备技术领域,具体涉及与猪生长性状相关联的SNP分子标记。所述的猪生长性状包括校正100KG日增重性状和校正100KG日龄性状。该分子标记克隆自登陆号为Affx‑114707063的基因片段,通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪生长性状相关的分子标记,其序列如SEQ ID NO:1所示,在序列的第51位碱基处存在一个A/T的等位基因突变;导致SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列产生多态性,且当该片段第51位核苷酸为A时,表明猪具有更快的生长速度。还公开了筛选与猪生长性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用。为猪生长性状的辅助选择提供了新的标记资源。
本发明属于猪分子标记制备技术领域,具体涉及一种与猪生长性状相关联的SNP分子标记。所述的猪生长性状包括校正100KG日增重性状和校正100KG日龄性状。该分子标记克隆自登陆号为WU_10.2_1_179575045的基因片段,通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪生长性状相关的分子标记,其序列如SEQ ID NO:1所示,在序列的第51位碱基处存在一个A/G的等位基因突变;导致SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列产生多态性,且当该片段第51位核苷酸为A时,表明猪具有更快的生长速度。还公开了筛选与猪生长性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用。为猪生长性状的辅助选择提供了新的标记资源。
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及与20日龄仔猪红细胞数目相关的分子标记及其应用。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0016595片段,通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变,且当SEQ ID NO:1上的第101位核苷酸为A时,则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
本发明属于动物分子标记筛选技术领域,具体涉及TRIM63基因片段作为母猪肢蹄骨密度SNP分子标记。本发明通过基因芯片技术对TRIM63基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第2301位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变,导致SEQ ID NO:1所示序列的多态性,且当SEQ ID NO:1上的第2301位核苷酸为G时,判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关标记的方法及其关联分析的应用。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了新的SNP分子标记。
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及一种与猪红细胞数目性状相关的SNP分子标记。该分子标记克隆自登陆号为ASGA0068286的基因,通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与猪红细胞数目性状相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第101位的碱基处存在一个T/C的等位基因突变,且当SEQ ID NO:1上的第101位核苷酸为C时,则猪具有更高的红细胞数目。公开了筛选与猪红细胞数目性状相关分子标记的方法及其关联分析方法的应用。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目性状的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记资源。
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及猪9号染色体基因间区单核苷酸多态作为猪红细胞数目性状的分子标记。通过基因芯片技术对登陆号为ASGA0082606基因进行分型,筛选得到一种与猪33日龄红细胞数目性状相关的分子标记,该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,在该序列的第101位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变。当SEQ ID NO:1所示序列上的第101位核苷酸为T时,表明猪具有更高的红细胞数目。本发明为猪免疫性状尤其是红细胞数目的标记辅助选择提供了一个新的SNP分子标记。
本发明属于动物分子标记筛选技术领域,具体涉及检测母猪肢蹄骨密度的SNP遗传标记该遗传标记克隆自ENSSSCG00000031404基因片段。通过基因芯片技术对该基因进行分型筛选得到一种与母猪肢蹄骨密度相关的遗传标记,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示,该序列的第51位的碱基处存在一个C/T的等位基因突变,导致该序列多态性;当SEQ ID NO:1上的第51位核苷酸为T时,判定母猪的肢蹄具有更高的骨密度。本发明公开了筛选与母猪肢蹄骨密度相关遗传标记的方法及其应用。为猪肢蹄结实度性状尤其是骨密度的标记辅助选择提供了一个新的SNP遗传标记。
本发明属于猪分子标记筛选技术领域,具体涉及克隆自InDel片段的与猪毛色性状相关的分子标记。该分子标记通过整合NCBI数据库和欧洲生物信息研究所中公开的包含58个品种的469头猪的重测序数据,对比猪参考基因组序列获得基因分型数据,根据全基因组关联分析(GWAS)得到一种与猪毛色性状相关的分子标记,即发生在Chr 11:50076946bp处的缺失,由原片段CTGGGAACTT缺失为C,具体核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。当个体基因型为CC时,有利于个体拥有渐变带毛色。本发明公开了筛选猪毛色性状相关分子标记的方法及其关联分析的应用,为猪毛色性状的标记辅助选择提供了新的InDel分子标记。